RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 PDE6CP51160 858 aa21.95■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 IRF2BP1Q8IU81 584 aa21.95■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 UBR7Q8N806 425 aa21.95■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 EHBP1Q8NDI1 1231 aa21.95■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 PDZD8Q8NEN9 1154 aa21.95■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 JAKMIP2Q96AA8 810 aa21.95■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 KCNH6Q9H252 994 aa21.95■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 THAP9Q9H5L6 903 aa21.95■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 COMMD8Q9NX08 183 aa21.95■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 GCNT4Q9P109 453 aa21.95■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 PFKLP17858 780 aa21.94■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 HDCP19113 662 aa21.94■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 PTMSP20962 102 aa21.94■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 PLCB2Q00722 1185 aa21.94■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 CCDC183Q5T5S1 534 aa21.94■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 FAM114A1Q8IWE2 563 aa21.94■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa21.94■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 OVCA2Q8WZ82 227 aa21.94■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 ZFYVE19Q96K21 471 aa21.94■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 FOXQ1Q9C009 403 aa21.94■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 IL37Q9NZH6 218 aa21.94■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 MYO16Q9Y6X6 1858 aa21.94■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 HELZP42694 1942 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 KANSL1LA0AUZ9 987 aa21.93■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 ARHGAP17Q68EM7 881 aa21.93■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 ARHGEF19Q8IW93 802 aa21.93■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 KAT5Q92993 513 aa21.93■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 PRRX2Q99811 253 aa21.93■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 DUSP16Q9BY84 665 aa21.93■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 FBXO44Q9H4M3 255 aa21.93■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 PNPLA8Q9NP80 782 aa21.93■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 PIAS3Q9Y6X2 628 aa21.93■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 FAM92AA1XBS5 289 aa21.92■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 HHLA1C9JL84 531 aa21.92■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 OAS1P00973 400 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 CD19P15391 556 aa21.92■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 CD72P21854 359 aa21.92■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 NUBP1P53384 320 aa21.92■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 GCNT1Q02742 428 aa21.92■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 USP4Q13107 963 aa21.92■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 UBXN2BQ14CS0 331 aa21.92■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 TMEM270Q6UE05 265 aa21.92■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 SASS6Q6UVJ0 657 aa21.92■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 RRAGAQ7L523 313 aa21.92■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa21.92■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 TTC16Q8NEE8 873 aa21.92■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 PJA1Q8NG27 643 aa21.92■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 RIN3Q8TB24 985 aa21.92■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 LTB4R2Q9NPC1 389 aa21.92■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 GMIPQ9P107 970 aa21.92■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa21.92■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 SIT1Q9Y3P8 196 aa21.92■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa21.92■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 MIA3Q5JRA6 1907 aa21.91■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 OLFM2O95897 454 aa21.91■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 ACO1P21399 889 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 ZNF77Q15935 545 aa21.91■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 SGO2Q562F6 1265 aa21.91■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa21.91■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 ZNF852Q6ZMS4 543 aa21.91■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 PRSS33Q8NF86 280 aa21.91■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 MAN2B1O00754 1011 aa21.9■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 TNK2Q07912 1038 aa21.9■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 MTF1Q14872 753 aa21.9■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 MAN2A1Q16706 1144 aa21.9■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa21.9■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 GBP6Q6ZN66 633 aa21.9■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 CCDC105Q8IYK2 499 aa21.9■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 TTC8Q8TAM2 541 aa21.9■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 SH3RF2Q8TEC5 729 aa21.9■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 CRACR2AQ9BSW2 395 aa21.9■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 RNF38Q9H0F5 515 aa21.9■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 GKN1Q9NS71 199 aa21.9■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 GTSE1Q9NYZ3 720 aa21.9■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 TSPAN16Q9UKR8 245 aa21.9■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
VARS-218ENST00000459667 SHISA7A6NL88 538 aa21.89■■□□□ 1.09
VARS-218ENST00000459667 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
VARS-218ENST00000459667 DCNP07585 359 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
VARS-218ENST00000459667 PAEPP09466 180 aa21.89■■□□□ 1.09
VARS-218ENST00000459667 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa21.89■■□□□ 1.09
VARS-218ENST00000459667 VDRP11473 427 aa21.89■■□□□ 1.09
VARS-218ENST00000459667 GLULP15104 373 aa21.89■■□□□ 1.09
VARS-218ENST00000459667 TCF3P15923 654 aa21.89■■□□□ 1.09
VARS-218ENST00000459667 TARSP26639 723 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
VARS-218ENST00000459667 SLC8A3P57103 927 aa21.89■■□□□ 1.09
VARS-218ENST00000459667 SLC7A9P82251 487 aa21.89■■□□□ 1.09
VARS-218ENST00000459667 SNX30Q5VWJ9 437 aa21.89■■□□□ 1.09
VARS-218ENST00000459667 TRIM65Q6PJ69 517 aa21.89■■□□□ 1.09
VARS-218ENST00000459667 TTC30AQ86WT1 665 aa21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms