RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446745.2

LTB-211, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 853 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-211ENST00000446745 TCF3P15923 654 aa22.34■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 NRLP54845 237 aa22.34■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 INCA1Q0VD86 236 aa22.34■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 TAF10Q12962 218 aa22.34■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 USP4Q13107 963 aa22.34■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 ZNF77Q15935 545 aa22.34■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 WDR44Q5JSH3 913 aa22.34■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 ASCL5Q7RTU5 278 aa22.34■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.34■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 SH3RF2Q8TEC5 729 aa22.34■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 OSCP1Q8WVF1 389 aa22.34■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 FBXO32Q969P5 355 aa22.34■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.34■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.34■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 KRT82Q9NSB4 513 aa22.34■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 CACNA2D1P54289 1103 aa22.33■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 NR1H3Q13133 447 aa22.33■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 PON2Q15165 354 aa22.33■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
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LTB-211ENST00000446745 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 FUKQ8N0W3 1084 aa22.33■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 ADSSL1Q8N142 457 aa22.33■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.33■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 SLC2A14Q8TDB8 520 aa22.33■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.33■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 SLC22A12Q96S37 553 aa22.33■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 ZSCAN32Q9NX65 697 aa22.33■■□□□ 1.17
LTB-211ENST00000446745 FAM186AA6NE01 2351 aa22.33■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 FANCMQ8IYD8 2048 aa22.33■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 FAM200BP0CF97 657 aa22.32■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.32■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 TRIM68Q6AZZ1 485 aa22.32■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 TXNDC11Q6PKC3 985 aa22.32■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 SPEM1Q8N4L4 309 aa22.32■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 KCNK16Q96T55 309 aa22.32■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 FBXO44Q9H4M3 255 aa22.32■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 HPS4Q9NQG7 708 aa22.32■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 RAB20Q9NX57 234 aa22.32■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 CCDC130P13994 396 aa22.31■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 CD58P19256 250 aa22.31■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 CXCL12P48061 93 aa22.31■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 SLC5A3P53794 718 aa22.31■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 SLC7A9P82251 487 aa22.31■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 ORC1Q13415 861 aa22.31■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 PAQR9Q6ZVX9 377 aa22.31■■□□□ 1.16
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LTB-211ENST00000446745 TMEM30AQ9NV96 361 aa22.31■■□□□ 1.16
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LTB-211ENST00000446745 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
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LTB-211ENST00000446745 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.3■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 WNT6Q9Y6F9 365 aa22.3■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 BICDL2A1A5D9 508 aa22.29■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 LEFTY2O00292 366 aa22.29■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 CILPO75339 1184 aa22.29■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 OLFM2O95897 454 aa22.29■■□□□ 1.16
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LTB-211ENST00000446745 ADORA2BP29275 332 aa22.29■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 TUBP50607 506 aa22.29■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 MAP3K7CLP57077 242 aa22.29■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 CCINQ13939 588 aa22.29■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 HECTD3Q5T447 861 aa22.29■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 C12orf29Q8N999 325 aa22.29■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 SCAMP5Q8TAC9 235 aa22.29■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 RIN3Q8TB24 985 aa22.29■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 NACA2Q9H009 215 aa22.29■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 CPQQ9Y646 472 aa22.29■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 TNFRSF10BO14763 440 aa22.28■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 ATG13O75143 517 aa22.28■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 DRD1P21728 446 aa22.28■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 EML3Q32P44 896 aa22.28■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 SNX30Q5VWJ9 437 aa22.28■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 TSSK4Q6SA08 328 aa22.28■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 ZBTB44Q8NCP5 570 aa22.28■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 CCDC26Q8TAB7 109 aa22.28■■□□□ 1.16
LTB-211ENST00000446745 SMOQ99835 787 aa22.28■■□□□ 1.16
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