RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424431.3

C9orf57-202, Transcript of chromosome 9 open reading frame 57, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf57, Length 1,297 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57-202ENST00000424431 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 PRAMEF4O60810 478 aa6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 STC2O76061 302 aa6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 DEXIO95424 95 aa6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 CFBP00751 764 aa6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 SNHG28P0DPA3 235 aa6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 TOP1P11387 765 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 OSMP13725 252 aa6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 GYPEP15421 78 aa6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 AGXTP21549 392 aa6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 SLC5A3P53794 718 aa6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 DUSP2Q05923 314 aa6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 NPY5RQ15761 445 aa6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 PALM2Q8IXS6 379 aa6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 GPR156Q8NFN8 814 aa6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 ARL8AQ96BM9 186 aa6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 TMEM39BQ9GZU3 492 aa6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 KAT14Q9H8E8 782 aa6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 CLIP2Q9UDT6 1046 aa6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 STX8Q9UNK0 236 aa6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 KIF3AQ9Y496 699 aa6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 GPR45Q9Y5Y3 372 aa6.45□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 MYH6P13533 1939 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 CAPN14A8MX76 684 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 TTLL1O95922 423 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 GOLGA8HP0CJ92 632 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 PDHBP11177 359 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 PTMSP20962 102 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 SMARCA1P28370 1054 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 PPP3CAQ08209 521 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 SEPT2Q15019 361 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 KLHL40Q2TBA0 621 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 MUM1L1Q5H9M0 696 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 MFSD5Q6N075 450 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 ANKRD35Q8N283 1001 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 MTMR8Q96EF0 704 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 PGBD1Q96JS3 809 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 USP28Q96RU2 1077 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 CPVLQ9H3G5 476 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 RIOX1Q9H6W3 641 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 GPRC5DQ9NZD1 345 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 NYAP2Q9P242 653 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 RCOR1Q9UKL0 485 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 KCNJ14Q9UNX9 436 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 MYH4Q9Y623 1939 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 A0A1W2PRG0 241 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 BTBD18B2RXH4 712 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 KLRF2D3W0D1 207 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 FIBPO43427 364 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 PCDHGA12O60330 932 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 PHF2O75151 1096 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 ITGA10O75578 1167 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 GASTP01350 101 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 MMP1P03956 469 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 RBP3P10745 1247 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 EEF2P13639 858 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 TNFRSF1AP19438 455 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 KIF5BP33176 963 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 EPS15P42566 896 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 GZMKP49863 264 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 KRT85P78386 507 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 MALLQ13021 153 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 ABCB5Q2M3G0 1257 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 MST1LQ2TV78 715 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 FAM214AQ32MH5 1076 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 ATL3Q6DD88 541 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 Q6ZVL8 140 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 GPC2Q8N158 579 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 WASF1Q92558 559 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 MIEF2Q96C03 454 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 SLC2A13Q96QE2 648 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 LZTS2Q9BRK4 669 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 SPZ1Q9BXG8 430 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf57-202ENST00000424431 VEZTQ9HBM0 779 aa6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms