RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 NFKBIEO00221 500 aa23.55■■□□□ 1.36
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HOXD1-201ENST00000331462 ELK3P41970 407 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 RAP1GAPP47736 663 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 BASP1P80723 227 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 PTK7Q13308 1070 aa23.55■■□□□ 1.36
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HOXD1-201ENST00000331462 RFWD2Q8NHY2 731 aa23.55■■□□□ 1.36
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HOXD1-201ENST00000331462 TSSK1BQ9BXA7 367 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 SYNCQ9H7C4 482 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 ASNSD1Q9NWL6 643 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.36
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HOXD1-201ENST00000331462 LPXNO60711 386 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 CILPO75339 1184 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
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HOXD1-201ENST00000331462 VRTNQ9H8Y1 702 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 CNTN3Q9P232 1028 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 KLF11O14901 512 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 MICAL2O94851 1124 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 MARK3P27448 753 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 TFDP2Q14188 446 aa23.54■■□□□ 1.36
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HOXD1-201ENST00000331462 FAM91A1Q658Y4 838 aa23.54■■□□□ 1.36
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HOXD1-201ENST00000331462 RTP4Q96DX8 246 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 CYP3A43Q9HB55 503 aa23.54■■□□□ 1.36
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HOXD1-201ENST00000331462 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
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HOXD1-201ENST00000331462 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 C1orf127Q8N9H9 656 aa23.53■■□□□ 1.36
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HOXD1-201ENST00000331462 TWNKQ96RR1 684 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 NUDCD1Q96RS6 583 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 PEBP4Q96S96 227 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 CALN1Q9BXU9 219 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 ELOVL4Q9GZR5 314 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 CDT1Q9H211 546 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 TNFSF13BQ9Y275 285 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 WDR91A4D1P6 747 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 GOLGA8RI6L899 631 aa23.52■■□□□ 1.36
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HOXD1-201ENST00000331462 EEF1DP3Q658K8 133 aa23.52■■□□□ 1.36
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HOXD1-201ENST00000331462 CXorf38Q8TB03 319 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 MIPEPQ99797 713 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 CNPY3Q9BT09 278 aa23.52■■□□□ 1.36
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HOXD1-201ENST00000331462 FZD1Q9UP38 647 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 INHBAP08476 426 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 ATICP31939 592 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 GPD2P43304 727 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
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HOXD1-201ENST00000331462 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
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HOXD1-201ENST00000331462 SMYD3Q9H7B4 428 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
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HOXD1-201ENST00000331462 ZNF180Q9UJW8 692 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 IKBKGQ9Y6K9 419 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 MGAMO43451 1857 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 CXCL8P10145 99 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 MAGEA6P43360 314 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 CDH8P55286 799 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 FAAP100Q0VG06 881 aa23.51■■□□□ 1.35
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HOXD1-201ENST00000331462 TAF11Q15544 211 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 APBB2Q92870 758 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 ADPGKQ9BRR6 497 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 PAK5Q9P286 719 aa23.51■■□□□ 1.35
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