RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 GCNAQ96QF7 691 aa23.58■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 PNPLA8Q9NP80 782 aa23.58■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 COMMD8Q9NX08 183 aa23.58■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 C2orf78A6NCI8 922 aa23.57■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 TULP2O00295 520 aa23.57■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa23.57■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 ZNF165P49910 485 aa23.57■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 COPB1P53618 953 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 SGO2Q562F6 1265 aa23.57■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 IER5LQ5T953 404 aa23.57■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa23.57■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 CYP2S1Q96SQ9 504 aa23.57■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 UBXN6Q9BZV1 441 aa23.57■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 DNAI2Q9GZS0 605 aa23.57■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 TSPAN16Q9UKR8 245 aa23.57■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 FAM86C2PA6NEL3 165 aa23.56■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 HEPACAM2A8MVW5 462 aa23.56■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 GPR37L1O60883 481 aa23.56■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 SRFP11831 508 aa23.56■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 CD19P15391 556 aa23.56■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 MFAP3P55082 362 aa23.56■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa23.56■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 LCLAT1Q6UWP7 414 aa23.56■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 RIN3Q8TB24 985 aa23.56■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 SHC3Q92529 594 aa23.56■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 ACP6Q9NPH0 428 aa23.56■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa23.56■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 EHD2Q9NZN4 543 aa23.56■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa23.56■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 ZMYM5Q9UJ78 669 aa23.56■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 DNAJC12Q9UKB3 198 aa23.56■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 CCL26Q9Y258 94 aa23.56■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 BRD2P25440 801 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 KIF11P52732 1056 aa23.55■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 CNGA2Q16280 664 aa23.55■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP44Q17R89 818 aa23.55■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa23.55■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 SNX30Q5VWJ9 437 aa23.55■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 MFSD6LQ8IWD5 586 aa23.55■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 OVCA2Q8WZ82 227 aa23.55■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 FAM81BQ96LP2 452 aa23.55■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 RNF38Q9H0F5 515 aa23.55■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 USP3Q9Y6I4 520 aa23.55■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 PES1O00541 588 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 PPP3CCP48454 512 aa23.54■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 KLK7P49862 253 aa23.54■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 ZXDBP98169 803 aa23.54■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 PDE4CQ08493 712 aa23.54■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 GRM2Q14416 872 aa23.54■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 RAB41Q5JT25 222 aa23.54■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 PIGZQ86VD9 579 aa23.54■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 UBA3Q8TBC4 463 aa23.54■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 FBXO32Q969P5 355 aa23.54■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 CBX8Q9HC52 389 aa23.54■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 OBP2AQ9NY56 170 aa23.54■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 SIK3Q9Y2K2 1263 aa23.54■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 TMEM221A6NGB7 291 aa23.53■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 SMTNL1A8MU46 457 aa23.53■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 M0R296 226 aa23.53■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 GABBR2O75899 941 aa23.53■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 OLFM2O95897 454 aa23.53■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 PSMC3P17980 439 aa23.53■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 SMYD5Q6GMV2 418 aa23.53■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 E2F7Q96AV8 911 aa23.53■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 SLITRK1Q96PX8 696 aa23.53■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa23.53■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 PLCB1Q9NQ66 1216 aa23.53■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 GMIPQ9P107 970 aa23.53■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 SCML2Q9UQR0 700 aa23.53■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 FHOD1Q9Y613 1164 aa23.53■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 LGALS16A8MUM7 142 aa23.52■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 ARNTLO00327 626 aa23.52■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 OAS1P00973 400 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 CFHP08603 1231 aa23.52■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 KRT5P13647 590 aa23.52■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 FCHO2Q0JRZ9 810 aa23.52■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 SLC35F5Q8WV83 523 aa23.52■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 GANQ9H2C0 597 aa23.52■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 FBXO44Q9H4M3 255 aa23.52■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 TRPC7Q9HCX4 862 aa23.52■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 TDP1Q9NUW8 608 aa23.52■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 OSER1Q9NX31 292 aa23.52■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 WNT16Q9UBV4 365 aa23.52■■□□□ 1.36
SYF2-201ENST00000236273 KRBA1A5PL33 1030 aa23.51■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 EPHB6O15197 1021 aa23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms