RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 AGMOQ6ZNB7 445 aa25.1■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 TTC13Q8NBP0 860 aa25.1■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 TRAIPQ9BWF2 469 aa25.1■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 B3GNT5Q9BYG0 378 aa25.1■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 TSPYL1Q9H0U9 437 aa25.1■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 ANAPC5Q9UJX4 755 aa25.1■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 NEU2Q9Y3R4 380 aa25.1■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 DPYSL4O14531 572 aa25.09■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 CST8O60676 142 aa25.09■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 LCP1P13796 627 aa25.09■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 SCNN1GP51170 649 aa25.09■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 ITGA8P53708 1063 aa25.09■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC14Q49A88 953 aa25.09■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa25.09■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 SENP8Q96LD8 212 aa25.09■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 IVDP26440 423 aa25.09■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 CLCNKBP51801 687 aa25.09■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 VCPP55072 806 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 LPIN1Q14693 890 aa25.09■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 SCYL2Q6P3W7 929 aa25.09■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 RFX6Q8HWS3 928 aa25.09■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 NCAPGQ9BPX3 1015 aa25.09■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 TMBIM4Q9HC24 238 aa25.09■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 CACNG4Q9UBN1 327 aa25.09■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 RARGP13631 454 aa25.08■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 DSTYKQ6XUX3 929 aa25.08■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 BBS12Q6ZW61 710 aa25.08■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM172AQ8WUF8 416 aa25.08■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 PKNOX2Q96KN3 472 aa25.08■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 HSFY1Q96LI6 401 aa25.08■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 GLT1D1Q96MS3 346 aa25.08■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 PEBP4Q96S96 227 aa25.08■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 CFHR5Q9BXR6 569 aa25.08■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 OSBPL7Q9BZF2 842 aa25.08■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 RSAD1Q9HA92 442 aa25.08■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 MIOSQ9NXC5 875 aa25.08■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF623O75123 536 aa25.08■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 CD48P09326 243 aa25.08■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 TAZQ16635 292 aa25.08■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 ATP2C2O75185 946 aa25.07■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 CAPN15O75808 1086 aa25.07■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 GABBR2O75899 941 aa25.07■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 RPL9P32969 192 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 CDH6P55285 790 aa25.07■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 KRT71Q3SY84 523 aa25.07■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC26A9Q7LBE3 791 aa25.07■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM86AQ8N2M4 240 aa25.07■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 SH2D3CQ8N5H7 860 aa25.07■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 ALLCQ8N6M5 410 aa25.07■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 PGBD4Q96DM1 585 aa25.07■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 ADAM2Q99965 735 aa25.07■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 MED10Q9BTT4 135 aa25.07■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 CASTOR2A6NHX0 329 aa25.06■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 MGEA5O60502 916 aa25.06■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 ITGAVP06756 1048 aa25.06■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 NUDT17P0C025 328 aa25.06■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 CAPN2P17655 700 aa25.06■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 KLRC2P26717 231 aa25.06■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 TKTP29401 623 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 SCNN1AP37088 669 aa25.06■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 LHX1P48742 406 aa25.06■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 KRT81Q14533 505 aa25.06■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 BOLA3Q53S33 107 aa25.06■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 IZUMO3Q5VZ72 239 aa25.06■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 MAP7D3Q8IWC1 876 aa25.06■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 ACTL9Q8TC94 416 aa25.06■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 DUSP16Q9BY84 665 aa25.06■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 SEMA4AQ9H3S1 761 aa25.06■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 CREBZFQ9NS37 354 aa25.06■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 A0A0U1RQF3 1178 aa25.06■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 SGK1O00141 431 aa25.06■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 GABRDO14764 452 aa25.06■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 SKIP12755 728 aa25.06■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 OASLQ15646 514 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 FUKQ8N0W3 1084 aa25.06■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 PXYLP1Q8TE99 480 aa25.06■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 CLEC4CQ8WTT0 213 aa25.06■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 MOXD2PA6NHM9 499 aa25.05■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 TP73O15350 636 aa25.05■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 RPL34P49207 117 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 ARSEP51690 589 aa25.05■■□□□ 1.6
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC29A2Q14542 456 aa25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms