RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000051221.12

Ankrd40-202, Transcript of Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd40, Length 1,477 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Lilra6A0A0B4J1F3 663 aa32.42■■■□□ 2.78
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Tmem215A7E1Z1 235 aa32.42■■■□□ 2.78
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 PurbO35295 324 aaKnown RBP32.42■■■□□ 2.78
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Stat4P42228 749 aa32.42■■■□□ 2.78
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Nle1Q8VEJ4 485 aa32.42■■■□□ 2.78
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Smg9Q9DB90 520 aa32.42■■■□□ 2.78
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Szt2A2A9C3 3431 aa32.41■■■□□ 2.78
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Rhox3hL7MU37 215 aa32.41■■■□□ 2.78
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Rhox3aQ4TU90 215 aa32.41■■■□□ 2.78
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Ms4a14A0A087WSD2 1232 aa32.4■■■□□ 2.78
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Kif12Q9D2Z8 642 aa32.4■■■□□ 2.78
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 KcpQ3U492 1550 aa32.39■■■□□ 2.78
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Gm3453K7N724 263 aa32.36■■■□□ 2.77
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Usp35M0QWN7 1009 aa32.36■■■□□ 2.77
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Hoxb8P09632 243 aa32.36■■■□□ 2.77
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Tars2Q3UQ84 723 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Ctxn3Q8BXZ0 80 aa32.36■■■□□ 2.77
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Tp53inp2Q8CFU8 221 aa32.36■■■□□ 2.77
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Fbxo32Q9CPU7 355 aa32.36■■■□□ 2.77
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Vmn2r72D3Z4N8 856 aa32.35■■■□□ 2.77
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