Protein–RNA interactions for Protein: Q3U492

Kcp, Kielin/chordin-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KcpQ3U492 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40,53■■■■■ 4,08
KcpQ3U492 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37,72■■■■□ 3,63
KcpQ3U492 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,84■■■■□ 3,49
KcpQ3U492 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35,45■■■■□ 3,27
KcpQ3U492 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35,35■■■■□ 3,25
KcpQ3U492 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34,71■■■■□ 3,15
KcpQ3U492 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
KcpQ3U492 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
KcpQ3U492 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
KcpQ3U492 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
KcpQ3U492 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
KcpQ3U492 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33,75■■■□□ 2,99
KcpQ3U492 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
KcpQ3U492 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33,13■■■□□ 2,89
KcpQ3U492 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,96■■■□□ 2,87
KcpQ3U492 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
KcpQ3U492 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32,79■■■□□ 2,84
KcpQ3U492 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,79■■■□□ 2,84
KcpQ3U492 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,77■■■□□ 2,84
KcpQ3U492 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
KcpQ3U492 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
KcpQ3U492 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
KcpQ3U492 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32,39■■■□□ 2,78
KcpQ3U492 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,38■■■□□ 2,77
KcpQ3U492 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
KcpQ3U492 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,74
KcpQ3U492 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32,08■■■□□ 2,73
KcpQ3U492 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
KcpQ3U492 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32,04■■■□□ 2,72
KcpQ3U492 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
KcpQ3U492 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
KcpQ3U492 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
KcpQ3U492 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,8■■■□□ 2,68
KcpQ3U492 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,65
KcpQ3U492 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
KcpQ3U492 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,47■■■□□ 2,63
KcpQ3U492 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
KcpQ3U492 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
KcpQ3U492 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,35■■■□□ 2,61
KcpQ3U492 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,22■■■□□ 2,59
KcpQ3U492 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31,13■■■□□ 2,57
KcpQ3U492 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,06■■■□□ 2,56
KcpQ3U492 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
KcpQ3U492 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30,95■■■□□ 2,54
KcpQ3U492 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30,89■■■□□ 2,54
KcpQ3U492 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30,86■■■□□ 2,53
KcpQ3U492 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
KcpQ3U492 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
KcpQ3U492 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30,64■■■□□ 2,5
KcpQ3U492 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30,63■■■□□ 2,49
KcpQ3U492 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
KcpQ3U492 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30,5■■■□□ 2,47
KcpQ3U492 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,5■■■□□ 2,47
KcpQ3U492 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,47■■■□□ 2,47
KcpQ3U492 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
KcpQ3U492 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,46
KcpQ3U492 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30,4■■■□□ 2,46
KcpQ3U492 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
KcpQ3U492 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,37■■■□□ 2,45
KcpQ3U492 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30,36■■■□□ 2,45
KcpQ3U492 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,34■■■□□ 2,45
KcpQ3U492 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,34■■■□□ 2,45
KcpQ3U492 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30,27■■■□□ 2,44
KcpQ3U492 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30,25■■■□□ 2,43
KcpQ3U492 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
KcpQ3U492 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
KcpQ3U492 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30,2■■■□□ 2,43
KcpQ3U492 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
KcpQ3U492 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
KcpQ3U492 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
KcpQ3U492 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
KcpQ3U492 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
KcpQ3U492 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
KcpQ3U492 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
KcpQ3U492 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,99■■■□□ 2,39
KcpQ3U492 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,96■■■□□ 2,39
KcpQ3U492 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29,9■■■□□ 2,38
KcpQ3U492 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
KcpQ3U492 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
KcpQ3U492 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
KcpQ3U492 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
KcpQ3U492 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
KcpQ3U492 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
KcpQ3U492 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
KcpQ3U492 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29,65■■■□□ 2,34
KcpQ3U492 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,64■■■□□ 2,33
KcpQ3U492 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29,64■■■□□ 2,33
KcpQ3U492 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,61■■■□□ 2,33
KcpQ3U492 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
KcpQ3U492 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
KcpQ3U492 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
KcpQ3U492 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29,52■■■□□ 2,32
KcpQ3U492 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
KcpQ3U492 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
KcpQ3U492 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29,46■■■□□ 2,31
KcpQ3U492 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
KcpQ3U492 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29,37■■■□□ 2,29
KcpQ3U492 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,36■■■□□ 2,29
KcpQ3U492 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,35■■■□□ 2,29
KcpQ3U492 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,1 ms