RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	YKL070W	P36087	169 aa		3.69	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	SPG4	Q04438	115 aa		3.69	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	YPL261C	Q08976	102 aa		3.69	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	CCW12	Q12127	133 aa		3.69	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		3.69	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	VAR1	P02381	398 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	RPL43B	P0CX26	92 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	PRY2	P36110	329 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	MIG3	P39943	394 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	YFR035C	P43608	114 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	YFR057W	P43625	151 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	TOS6	P48560	102 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	YML079W	Q03629	201 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	AIM34	Q03673	198 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	TAR1	Q8TGM6	124 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	Q0255	P03881	472 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	3.67	□□□□□ -1.82	not detected
TRS33	YOR115C	DCV1	P43595	202 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	KEG1	P43614	200 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	FIP1	P45976	327 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	YNR077C	P53758	84 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	ELC1	Q03071	99 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	YMR244W	Q04018	355 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	RRG8	Q06109	277 aa		3.66	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	YLR042C	Q07990	161 aa		3.66	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	MSA1	Q08471	629 aa		3.66	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		3.66	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		3.66	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	PAI3	P01094	68 aa		3.65	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	ATP15	P21306	62 aa		3.65	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	RPB9	P27999	122 aa		3.65	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	YKR041W	P36134	250 aa		3.65	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	OXA1	P39952	402 aa		3.65	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	YJR146W	P47174	117 aa		3.65	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	AIM11	P87275	137 aa		3.65	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	CIN5	P40917	295 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	YGL088W	P53151	121 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	MRPS8	Q03799	155 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	RUB1	Q03919	77 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	YLR296W	Q05898	108 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	PRM3	Q08931	133 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	ANB1	P19211	157 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	RRT13	P40042	185 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	YER181C	P40097	107 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	SCW10	Q04951	389 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	MID2	P36027	376 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	YBR209W	P38311	105 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	YER085C	P40058	173 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	IGO2	Q9P305	131 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	AIM29	P36154	155 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	MRPS12	P53732	153 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	YNL190W	P53872	204 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	YLR194C	Q05777	254 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	COX14	P39103	70 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	YEL008W	P40001	126 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	AGE2	P40529	298 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	YCH1	P42937	148 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	ALG13	P53178	202 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	TRP1	P00912	224 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	UGX2	P32772	223 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	YNL217W	P40152	326 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TRS33	YOR115C	CCW14	O13547	238 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TRS33	YOR115C	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TRS33	YOR115C	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TRS33	YOR115C	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TRS33	YOR115C	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TRS33	YOR115C	YIL059C	P40520	121 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TRS33	YOR115C	YPL257W	Q08974	193 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TRS33	YOR115C	PPT2	Q12036	173 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TRS33	YOR115C	SLO1	Q3E784	85 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TRS33	YOR115C	CUP1-1	P0CX80	61 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRS33	YOR115C	CUP1-2	P0CX81	61 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRS33	YOR115C	SHU1	P38751	150 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRS33	YOR115C	PEX17	P40155	199 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRS33	YOR115C	YPS5	P53057	165 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TRS33	YOR115C	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TRS33	YOR115C	POP7	P38291	140 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRS33	YOR115C	KRE9	P39005	276 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRS33	YOR115C	PMP3	P87284	55 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TRS33	YOR115C	UBC5	P15732	148 aa		3.55	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.4 ms