RNA–Protein interactions for RNA: YMR213W

CEF1, Transcript of Essential splicing factor, yeast

Gene CEF1, Length 1,773 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CEF1	YMR213W	HSK3	P69852	69 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEF1	YMR213W	YOR029W	Q12243	111 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEF1	YMR213W	IES6	P32617	166 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CEF1	YMR213W	SIM1	P40472	476 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CEF1	YMR213W	YGR164W	P53291	111 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CEF1	YMR213W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CEF1	YMR213W	MXR2	P25566	168 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CEF1	YMR213W	TOS6	P48560	102 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CEF1	YMR213W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CEF1	YMR213W	AGA1	P32323	725 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CEF1	YMR213W	YAR029W	P39549	74 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CEF1	YMR213W	YGR219W	P53307	113 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CEF1	YMR213W	YLR281C	Q05863	155 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CEF1	YMR213W	COX17	Q12287	69 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CEF1	YMR213W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	YCR022C	P25620	114 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	YBL071C	P38185	102 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	YER187W	P40102	141 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	NRM1	P53718	249 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	LDB16	P25587	256 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	YBR209W	P38311	105 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	YGR018C	P53211	109 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	PRM7	Q12459	698 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	RPS27B	P38711	82 aa		5	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	MPC2	P38857	129 aa		5	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	PCP1	P53259	346 aa		5	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	HAL1	Q01766	294 aa		5	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	GAT3	Q07928	141 aa		5	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	UBC4	P15731	148 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	SPI1	P40092	148 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	YNL190W	P53872	204 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	ATP15	P21306	62 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	MMS2	P53152	137 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	DCV1	P43595	202 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	HUR1	P45820	110 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	GLO1	P50107	326 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CEF1	YMR213W	MTC6	P38849	526 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CEF1	YMR213W	PEX22	P39718	180 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CEF1	YMR213W	YML122C	Q03207	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CEF1	YMR213W	CCW14	O13547	238 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEF1	YMR213W	CTR2	P38865	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEF1	YMR213W	YFL019C	P43576	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEF1	YMR213W	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CEF1	YMR213W	PPT2	Q12036	173 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEF1	YMR213W	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEF1	YMR213W	YKR073C	P36153	106 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEF1	YMR213W	YHR022C	P38763	256 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEF1	YMR213W	MSA2	P36157	363 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEF1	YMR213W	TAO3	P40468	2376 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEF1	YMR213W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CEF1	YMR213W	REE1	P40893	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEF1	YMR213W	MRPS12	P53732	153 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEF1	YMR213W	YDR114C	Q04597	100 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEF1	YMR213W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CEF1	YMR213W	RRT15	Q3E811	62 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEF1	YMR213W	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEF1	YMR213W	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CEF1	YMR213W	MED6	P38782	295 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEF1	YMR213W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CEF1	YMR213W	PEX17	P40155	199 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CEF1	YMR213W	BLM10	P43583	2143 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CEF1	YMR213W	IMP2	P46972	177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CEF1	YMR213W	YNL046W	P53956	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CEF1	YMR213W	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CEF1	YMR213W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CEF1	YMR213W	YLR156W	P0CE96	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEF1	YMR213W	YLR159W	P0CE97	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEF1	YMR213W	YLR161W	P0CE98	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEF1	YMR213W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CEF1	YMR213W	RRT1	P38192	103 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEF1	YMR213W	KEG1	P43614	200 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEF1	YMR213W	PIR5	P46999	287 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEF1	YMR213W	ICY1	Q04329	127 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEF1	YMR213W	VPS13	Q07878	3144 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEF1	YMR213W	SPS100	P13130	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEF1	YMR213W	PGU1	P47180	361 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEF1	YMR213W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEF1	YMR213W	ATP20	Q12233	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEF1	YMR213W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CEF1	YMR213W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CEF1	YMR213W	YMR295C	Q03559	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEF1	YMR213W	YOR268C	Q08734	132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEF1	YMR213W	YLR122C	Q12312	125 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEF1	YMR213W	MIC10	Q96VH5	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEF1	YMR213W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CEF1	YMR213W	SHU1	P38751	150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEF1	YMR213W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.9 ms