RNA–Protein interactions for RNA: YLR368W

MDM30, Transcript of F-box component of an SCF ubiquitin protein ligase complex, yeastyeast

Gene MDM30, Length 1,797 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDM30YLR368W LSM6Q06406 86 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
MDM30YLR368W SMT3Q12306 101 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
MDM30YLR368W SEC11P15367 167 aa3.3□□□□□ -1.88
MDM30YLR368W PAU24P38155 120 aa3.3□□□□□ -1.88
MDM30YLR368W RPL22BP56628 122 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
MDM30YLR368W MET31Q03081 177 aa3.3□□□□□ -1.88
MDM30YLR368W AYT1Q12226 474 aa3.3□□□□□ -1.88
MDM30YLR368W YPL247CQ12523 523 aa3.3□□□□□ -1.88
MDM30YLR368W YHR214C-DP0CX93 97 aa3.3□□□□□ -1.88
MDM30YLR368W FKS1P38631 1876 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
MDM30YLR368W YNL208WP40159 199 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
MDM30YLR368W BNS1P50084 137 aa3.3□□□□□ -1.88
MDM30YLR368W MPC3P53311 146 aa3.3□□□□□ -1.88
MDM30YLR368W PIR1Q03178 341 aa3.3□□□□□ -1.88
MDM30YLR368W HPA2Q06592 156 aa3.3□□□□□ -1.88
MDM30YLR368W YOL029CQ08187 201 aa3.3□□□□□ -1.88
MDM30YLR368W YKL023C-AQ2V2P3 75 aa3.3□□□□□ -1.88
MDM30YLR368W RPL26AP05743 127 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
MDM30YLR368W PTH1P38876 190 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
MDM30YLR368W IMP2P46972 177 aa3.29□□□□□ -1.88
MDM30YLR368W YMR244WQ04018 355 aa3.29□□□□□ -1.88
MDM30YLR368W CRC1Q12289 327 aa3.29□□□□□ -1.88
MDM30YLR368W MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
MDM30YLR368W YHR180WP38868 163 aa3.28□□□□□ -1.88
MDM30YLR368W IRC19Q07843 230 aa3.28□□□□□ -1.88
MDM30YLR368W TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
MDM30YLR368W YOR381W-AQ3E804 55 aa3.28□□□□□ -1.88
MDM30YLR368W OST5Q92316 86 aa3.28□□□□□ -1.88
MDM30YLR368W RPS19AP07280 144 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W LST8P41318 303 aa3.28□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W RGM1Q00453 211 aa3.28□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W YOL118CQ08259 102 aa3.28□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W DNF2Q12675 1612 aa3.27□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W CIS3P47001 227 aa3.27□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W YJR085CP47131 105 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W YDL241WQ07738 123 aa3.27□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W YOR343CQ12484 108 aa3.27□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W TIM12P32830 109 aa3.26□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W YIR020CP40575 100 aa3.26□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W CYR1P08678 2026 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W SOD1P00445 154 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W ASK1P35734 292 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W HSP10P38910 106 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W ECO1P43605 281 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W IRC23Q08416 157 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W MHF2Q3E829 80 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W FLO9P39712 1322 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W UTH1P36135 365 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W YHR125WP38831 101 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W VPS55P47111 140 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W YGL118CP53132 145 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W CRH1P53301 507 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W YLR111WQ12528 110 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W SDH3P33421 198 aa3.24□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W YIL054WP40524 105 aa3.24□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W BRP1P53194 125 aa3.24□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W TVP15Q03860 143 aa3.24□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W COX19Q3E731 98 aa3.24□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W SLH1P53327 1967 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W YAL065CO13511 128 aa3.23□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W ROX3P25046 220 aa3.23□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W DCV1P43595 202 aa3.23□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W YDR115WQ04598 105 aa3.23□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W YOR314WQ12506 109 aa3.23□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W YER078W-AQ3E7A2 54 aa3.23□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W PFY1P07274 126 aa3.22□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W YJL197C-AP0C5P0 93 aa3.22□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W FPR2P32472 135 aa3.22□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W YBL059WP34224 193 aa3.22□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W YEL067CP39978 195 aa3.22□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W API2Q04413 109 aa3.22□□□□□ -1.89
MDM30YLR368W RPS22AP0C0W1 130 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
MDM30YLR368W YHR173CP38864 112 aa3.21□□□□□ -1.9
MDM30YLR368W PPT2Q12036 173 aa3.21□□□□□ -1.9
MDM30YLR368W RTC6O14464 93 aa3.2□□□□□ -1.9
MDM30YLR368W RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
MDM30YLR368W RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
MDM30YLR368W YSY6P38374 65 aa3.2□□□□□ -1.9
MDM30YLR368W RPR2P40571 144 aa3.2□□□□□ -1.9
MDM30YLR368W YGR121W-AQ3E816 71 aa3.2□□□□□ -1.9
MDM30YLR368W DNF3Q12674 1656 aa3.2□□□□□ -1.9
MDM30YLR368W IML1P47170 1584 aa3.2□□□□□ -1.9
MDM30YLR368W YGL149WP53116 101 aa3.2□□□□□ -1.9
MDM30YLR368W YIL014C-AQ02598 104 aa3.2□□□□□ -1.9
MDM30YLR368W YDR246W-AQ3E763 66 aa3.2□□□□□ -1.9
MDM30YLR368W URB1P34241 1764 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
MDM30YLR368W VMR1P38735 1592 aa3.19□□□□□ -1.9
MDM30YLR368W BUD3P25558 1636 aa3.19□□□□□ -1.9
MDM30YLR368W ECM19Q06011 112 aa3.19□□□□□ -1.9
MDM30YLR368W YLR162WQ06235 118 aa3.19□□□□□ -1.9
MDM30YLR368W YPR153WQ06537 140 aa3.19□□□□□ -1.9
MDM30YLR368W RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
MDM30YLR368W STT4P37297 1900 aa3.19□□□□□ -1.9
MDM30YLR368W YER188C-AP0C0V2 99 aa3.18□□□□□ -1.9
MDM30YLR368W YHR032W-AP0C5N6 59 aa3.18□□□□□ -1.9
MDM30YLR368W SRX1P36077 127 aa3.18□□□□□ -1.9
MDM30YLR368W COX23P38824 151 aa3.18□□□□□ -1.9
MDM30YLR368W SPI1P40092 148 aa3.18□□□□□ -1.9
MDM30YLR368W YFL051CP43552 160 aa3.18□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.6 ms