RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W COX12Q01519 83 aa9.99□□□□□ -0.81
SSA4YER103W RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SSA4YER103W RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SSA4YER103W YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa9.98□□□□□ -0.81
SSA4YER103W LCB3P47013 409 aa9.97□□□□□ -0.81
SSA4YER103W SED1Q01589 338 aa9.97□□□□□ -0.81
SSA4YER103W PBP4Q07362 185 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SSA4YER103W CCW14O13547 238 aa9.96□□□□□ -0.81
SSA4YER103W YNL190WP53872 204 aa9.96□□□□□ -0.81
SSA4YER103W MRPS12P53732 153 aa9.95□□□□□ -0.82
SSA4YER103W YCL021W-AQ96VH3 125 aa9.95□□□□□ -0.82
SSA4YER103W RAD6P06104 172 aa9.95□□□□□ -0.82
SSA4YER103W YHR139C-AO13536 103 aa9.94□□□□□ -0.82
SSA4YER103W YCH1P42937 148 aa9.94□□□□□ -0.82
SSA4YER103W YGR045CP53229 120 aa9.94□□□□□ -0.82
SSA4YER103W POR2P40478 281 aa9.94□□□□□ -0.82
SSA4YER103W DCV1P43595 202 aa9.94□□□□□ -0.82
SSA4YER103W YGR219WP53307 113 aa9.94□□□□□ -0.82
SSA4YER103W RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
SSA4YER103W RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
SSA4YER103W LDB16P25587 256 aa9.93□□□□□ -0.82
SSA4YER103W SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data9.93□□□□□ -0.82not detected
SSA4YER103W YGR025WP53216 100 aa9.93□□□□□ -0.82
SSA4YER103W YNL046WP53956 172 aa9.93□□□□□ -0.82
SSA4YER103W VMA11P32842 164 aa9.92□□□□□ -0.82
SSA4YER103W MRPL24P36525 258 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SSA4YER103W MIC12P38341 106 aa9.92□□□□□ -0.82
SSA4YER103W COF1Q03048 143 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
SSA4YER103W YJR146WP47174 117 aa9.9□□□□□ -0.82
SSA4YER103W PEX17P40155 199 aa9.9□□□□□ -0.83
SSA4YER103W AIM19P40502 157 aa9.9□□□□□ -0.83
SSA4YER103W YDR381C-AQ3E6R5 114 aa9.9□□□□□ -0.83
SSA4YER103W PBI2P0CT04 75 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
SSA4YER103W INO2P26798 304 aa9.89□□□□□ -0.83
SSA4YER103W RPL16AP26784 199 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
SSA4YER103W WWM1P43582 211 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
SSA4YER103W YOL085CQ99345 113 aa9.88□□□□□ -0.83
SSA4YER103W YLR415CO13578 112 aa9.88□□□□□ -0.83
SSA4YER103W SMP1P38128 452 aa9.88□□□□□ -0.83
SSA4YER103W YER121WP40076 114 aa9.88□□□□□ -0.83
SSA4YER103W YIL059CP40520 121 aa9.88□□□□□ -0.83
SSA4YER103W YHL042WP38729 150 aa9.87□□□□□ -0.83
SSA4YER103W KNH1P50112 268 aa9.87□□□□□ -0.83
SSA4YER103W YBR200W-AQ3E755 54 aa9.87□□□□□ -0.83
SSA4YER103W IES6P32617 166 aa9.86□□□□□ -0.83
SSA4YER103W YHL037CP38733 133 aa9.86□□□□□ -0.83
SSA4YER103W YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa9.86□□□□□ -0.83
SSA4YER103W KEG1P43614 200 aa9.85□□□□□ -0.83
SSA4YER103W CAX4P53223 239 aa9.84□□□□□ -0.83
SSA4YER103W PBA1Q05778 276 aa9.84□□□□□ -0.83
SSA4YER103W YDR029WQ12111 104 aa9.84□□□□□ -0.83
SSA4YER103W YHR022CP38763 256 aa9.84□□□□□ -0.83
SSA4YER103W BNA1P47096 177 aa9.83□□□□□ -0.84
SSA4YER103W TRP1P00912 224 aa9.82□□□□□ -0.84
SSA4YER103W ECM12O13529 151 aa9.81□□□□□ -0.84
SSA4YER103W SHU1P38751 150 aa9.81□□□□□ -0.84
SSA4YER103W RPL15AP05748 204 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SSA4YER103W HUR1P45820 110 aa9.8□□□□□ -0.84
SSA4YER103W YPL038W-AQ3E7B4 63 aa9.8□□□□□ -0.84
SSA4YER103W BPH1P25356 2167 aa9.78□□□□□ -0.84
SSA4YER103W CCW12Q12127 133 aa9.78□□□□□ -0.84
SSA4YER103W YER039C-AP0CD97 72 aa9.77□□□□□ -0.85
SSA4YER103W NCE103P53615 221 aa9.77□□□□□ -0.85
SSA4YER103W MPC2P38857 129 aa9.76□□□□□ -0.85
SSA4YER103W SHH4Q06236 168 aa9.76□□□□□ -0.85
SSA4YER103W RPL16BP26785 198 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
SSA4YER103W QCR8P08525 94 aa9.75□□□□□ -0.85
SSA4YER103W MSA2P36157 363 aa9.75□□□□□ -0.85
SSA4YER103W TOM6P33448 61 aa9.74□□□□□ -0.85
SSA4YER103W YLR042CQ07990 161 aa9.74□□□□□ -0.85
SSA4YER103W EMC6Q12431 108 aa9.74□□□□□ -0.85
SSA4YER103W YBR209WP38311 105 aa9.73□□□□□ -0.85
SSA4YER103W YGL088WP53151 121 aa9.73□□□□□ -0.85
SSA4YER103W UBC5P15732 148 aa9.72□□□□□ -0.85
SSA4YER103W SVP26P38869 228 aa9.72□□□□□ -0.85
SSA4YER103W RRT13P40042 185 aa9.72□□□□□ -0.85
SSA4YER103W YML122CQ03207 126 aa9.72□□□□□ -0.85
SSA4YER103W FMP27Q06179 2628 aa9.72□□□□□ -0.85
SSA4YER103W YEL008WP40001 126 aa9.72□□□□□ -0.85
SSA4YER103W SIM1P40472 476 aa9.72□□□□□ -0.85
SSA4YER103W YOR011W-AQ3E807 68 aa9.7□□□□□ -0.86
SSA4YER103W RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
SSA4YER103W RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
SSA4YER103W YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
SSA4YER103W YPR013CQ12145 317 aa9.69□□□□□ -0.86
SSA4YER103W KRE9P39005 276 aa9.68□□□□□ -0.86
SSA4YER103W SBH2P52871 88 aa9.68□□□□□ -0.86
SSA4YER103W RGM1Q00453 211 aa9.68□□□□□ -0.86
SSA4YER103W STF1P01098 86 aa9.68□□□□□ -0.86
SSA4YER103W PPT2Q12036 173 aa9.68□□□□□ -0.86
SSA4YER103W YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa9.68□□□□□ -0.86
SSA4YER103W YSY6P38374 65 aa9.67□□□□□ -0.86
SSA4YER103W SUT1P53032 299 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
SSA4YER103W YER135CP40082 130 aa9.65□□□□□ -0.86
SSA4YER103W ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data9.65□□□□□ -0.86not detected
SSA4YER103W YOR034C-AQ3E735 80 aa9.65□□□□□ -0.86
SSA4YER103W IRA1P18963 3092 aa9.64□□□□□ -0.87
SSA4YER103W YNL194CP40169 301 aa9.62□□□□□ -0.87
SSA4YER103W YCR050CP25630 102 aa9.61□□□□□ -0.87
SSA4YER103W COX17Q12287 69 aa9.61□□□□□ -0.87
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