RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599560.5

NUP62-216, Transcript of nucleoporin 62, human

TSL 2

Gene NUP62, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUP62-216	ENST00000599560		A0A1W2PQF6	199 aa		13.06	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	LEFTY2	O00292	366 aa		13.06	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	CYB561D2	O14569	222 aa		13.06	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	TRIM24	O15164	1050 aa		13.06	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	ARHGAP6	O43182	974 aa		13.06	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	ADRB2	P07550	413 aa		13.06	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	CLTA	P09496	248 aa		13.06	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	CSH1	P0DML2	217 aa		13.06	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	CSH2	P0DML3	217 aa		13.06	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		13.06	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	MYO1E	Q12965	1108 aa		13.06	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		13.06	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		13.06	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	MYRFL	Q96LU7	910 aa		13.06	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	ACOX2	Q99424	681 aa		13.06	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		13.06	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		13.06	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		13.06	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	STK24	Q9Y6E0	443 aa		13.06	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	NUMA1	Q14980	2115 aa		13.06	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	PLK4	O00444	970 aa		13.05	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	CLDN3	O15551	220 aa		13.05	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	APOD	P05090	189 aa		13.05	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	TCF3	P15923	654 aa		13.05	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	HDC	P19113	662 aa		13.05	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	NDUFV2	P19404	249 aa		13.05	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	PSMA5	P28066	241 aa		13.05	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	CFHR1	Q03591	330 aa		13.05	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		13.05	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		13.05	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	KCNK18	Q7Z418	384 aa		13.05	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		13.05	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	FAM212A	Q96EL1	285 aa		13.05	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	PKMYT1	Q99640	499 aa		13.05	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		13.05	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	RNF38	Q9H0F5	515 aa		13.05	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		13.05	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		13.05	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		13.05	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		13.05	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	MYMK	A6NI61	221 aa		13.04	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	CILP	O75339	1184 aa		13.04	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	CDC45	O75419	566 aa		13.04	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	XBP1	P17861	261 aa		13.04	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	13.04	□□□□□ -0.32	2e-6	■■■■□ 22
NUP62-216	ENST00000599560	REST	Q13127	1097 aa		13.04	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	CCDC157	Q569K6	752 aa		13.04	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		13.04	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		13.04	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		13.04	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	ERMN	Q8TAM6	284 aa		13.04	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	SPATA18	Q8TC71	538 aa		13.04	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	GAREM1	Q9H706	876 aa		13.04	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		13.04	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	MYH10	P35580	1976 aa		13.03	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	GRIA2	P42262	883 aa		13.03	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	USP46	P62068	366 aa		13.03	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	13.03	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	KCNB1	Q14721	858 aa		13.03	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF174	Q15697	407 aa		13.03	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		13.03	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	DHRS13	Q6UX07	377 aa		13.03	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	ZPBP2	Q6X784	338 aa		13.03	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		13.03	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	NAT16	Q8N8M0	369 aa		13.03	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		13.03	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		13.03	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	13.03	□□□□□ -0.32
NUP62-216	ENST00000599560	PP2D1	A8MPX8	630 aa		13.02	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	OR52Z1	P0C646	297 aa		13.02	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	KRT10	P13645	584 aa		13.02	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	HOXB2	P14652	356 aa		13.02	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	TNFRSF4	P43489	277 aa		13.02	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	SMARCB1	Q12824	385 aa		13.02	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	STRN3	Q13033	797 aa		13.02	□□□□□ -0.33
NUP62-216	ENST00000599560	PTPRN	Q16849	979 aa		13.02	□□□□□ -0.33

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