RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558773.1

MFGE8-208, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 3

Gene MFGE8, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-208ENST00000558773 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa21.4■■□□□ 1.02
MFGE8-208ENST00000558773 OR6B3Q8NGW1 331 aa21.4■■□□□ 1.02
MFGE8-208ENST00000558773 PLEKHO2Q8TD55 490 aa21.4■■□□□ 1.02
MFGE8-208ENST00000558773 TMEM174Q8WUU8 243 aa21.4■■□□□ 1.02
MFGE8-208ENST00000558773 C8orf48Q96LL4 319 aa21.4■■□□□ 1.02
MFGE8-208ENST00000558773 SERTAD1Q9UHV2 236 aa21.4■■□□□ 1.02
MFGE8-208ENST00000558773 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa21.4■■□□□ 1.02
MFGE8-208ENST00000558773 TRIM66O15016 1216 aa21.39■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 EXOC3O60645 756 aa21.39■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 LRP3O75074 770 aa21.39■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 ATG13O75143 517 aa21.39■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 EGFP01133 1207 aa21.39■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 DRD1P21728 446 aa21.39■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 ZXDBP98169 803 aa21.39■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 MDH1BQ5I0G3 518 aa21.39■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 CPA6Q8N4T0 437 aa21.39■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 SH3RF2Q8TEC5 729 aa21.39■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 P2RY13Q9BPV8 354 aa21.39■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 VRTNQ9H8Y1 702 aa21.39■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 DMAC2Q9NW81 257 aa21.39■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 EHD2Q9NZN4 543 aa21.39■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 USP18Q9UMW8 372 aa21.39■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 WNT6Q9Y6F9 365 aa21.39■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa21.38■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 ZNF840PA6NDX5 716 aa21.38■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 F8VP50 259 aa21.38■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 ANXA13P27216 316 aa21.38■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 PPP3CCP48454 512 aa21.38■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 IFNAR2P48551 515 aa21.38■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 CASP4P49662 377 aa21.38■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 PDE6CP51160 858 aa21.38■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 TNNC1P63316 161 aa21.38■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 SPEM2Q0P670 501 aa21.38■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 STK4Q13043 487 aa21.38■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 TRPC3Q13507 836 aa21.38■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 KCNB1Q14721 858 aa21.38■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 CEP57L1Q8IYX8 460 aa21.38■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 GOLGA5Q8TBA6 731 aa21.38■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 PARD3BQ8TEW8 1205 aa21.38■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 ATP2A3Q93084 1043 aa21.38■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 PAGE5Q96GU1 130 aa21.38■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 LINC00597Q9H2U6 94 aa21.38■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 DPEP3Q9H4B8 488 aa21.38■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 TMEM30AQ9NV96 361 aa21.38■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa21.38■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 OLFM2O95897 454 aa21.37■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 AP3M2P53677 418 aa21.37■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 CACNA2D1P54289 1103 aa21.37■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 PSMD2Q13200 908 aa21.37■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 FBXO43Q4G163 708 aa21.37■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 SLC9A9Q8IVB4 645 aa21.37■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 KIAA1958Q8N8K9 716 aa21.37■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 KIAA0895Q8NCT3 520 aa21.37■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 B3GNT5Q9BYG0 378 aa21.37■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 HELZP42694 1942 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 A8MXQ7 604 aa21.36■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 RNF40O75150 1001 aa21.36■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 SLC7A9P82251 487 aa21.36■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa21.36■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 CD101Q93033 1021 aa21.36■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 EXOC4Q96A65 974 aa21.36■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa21.36■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 ELOVL4Q9GZR5 314 aa21.36■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 RNF38Q9H0F5 515 aa21.36■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 KCTD10Q9H3F6 313 aa21.36■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 PHACTR2O75167 634 aa21.35■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 CMA1P23946 247 aa21.35■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 NR1H3Q13133 447 aa21.35■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 KMT5BQ4FZB7 885 aa21.35■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 CAMKK1Q8N5S9 505 aa21.35■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.35■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 SEMA4GQ9NTN9 838 aa21.35■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 SLC8A2Q9UPR5 921 aa21.35■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 HPSEQ9Y251 543 aa21.35■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 LEFTY2O00292 366 aa21.34■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 CLDN5O00501 218 aa21.34■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 PDXKO00764 312 aa21.34■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 OAS1P00973 400 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 PXNP49023 591 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 CDH8P55286 799 aa21.34■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 TAF10Q12962 218 aa21.34■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 CSRP2Q16527 193 aa21.34■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 CEP68Q76N32 757 aa21.34■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 TTC16Q8NEE8 873 aa21.34■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 GAB3Q8WWW8 586 aa21.34■■□□□ 1.01
MFGE8-208ENST00000558773 RTKNQ9BST9 563 aa21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms