RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557355.1

LINC01146-208, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1146, human

TSL 4 BASIC

Gene LINC01146, Length 548 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC01146-208	ENST00000557355	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	IL1R2	P27930	398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	LIPA	P38571	399 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	STAT4	Q14765	748 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	CCDC93	Q567U6	631 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	LYZL4	Q96KX0	146 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	NELL2	Q99435	816 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	RLIM	Q9NVW2	624 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	RAD54B	Q9Y620	910 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	NPAT	Q14207	1427 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	PRKD3	O94806	890 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	TREML2	Q5T2D2	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	MAVS	Q7Z434	540 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	SIK2	Q9H0K1	926 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	MYOM1	P52179	1685 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355		H7C1Q1	480 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	FCHO1	O14526	889 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	VPS4B	O75351	444 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	GJB1	P08034	283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	NPS	P0C0P6	89 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	CYP2C19	P33261	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	SOX5	P35711	763 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	CLCN2	P51788	898 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	SEMA3A	Q14563	771 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	AFAP1	Q8N556	730 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	KANK1	Q14678	1352 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	F2RL2	O00254	374 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	USP1	O94782	785 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	GNAI3	P08754	354 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	PRF1	P14222	555 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	KCNJ5	P48544	419 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	SLC16A1	P53985	500 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	PDE1A	P54750	535 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	GNAI1	P63096	354 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	ICE2	Q659A1	982 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	FCRL6	Q6DN72	434 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	UBXN4	Q92575	508 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	NOS1	P29475	1434 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	ERVK-7	P63135	1459 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	GYS2	P54840	703 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	ERVK-21	P61565	698 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	TCF15	Q12870	199 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01146-208	ENST00000557355	IL10RA	Q13651	578 aa		4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms