RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 CLUL1Q15846 466 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 WDR72Q3MJ13 1102 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ACCSLQ4AC99 568 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ZNF394Q53GI3 561 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ALS2CLQ60I27 953 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
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CS-204ENST00000546621 SMC1BQ8NDV3 1235 aa8.19□□□□□ -1.1
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CS-204ENST00000546621 AP1M1Q9BXS5 423 aa8.19□□□□□ -1.1
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CS-204ENST00000546621 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa8.19□□□□□ -1.1
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CS-204ENST00000546621 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 MYADML2A6NDP7 307 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 BIRC5O15392 142 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 RAD51CO43502 376 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 TPPPO94811 219 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 FGGP02679 453 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CALB1P05937 261 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 GSTA2P09210 222 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 PAEPP09466 180 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 MMP8P22894 467 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CCND1P24385 295 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 LSP1P33241 339 aa8.18□□□□□ -1.1
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CS-204ENST00000546621 SLC1A1P43005 524 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 RAP1GAPP47736 663 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 MARCKSL1P49006 195 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 PEX5P50542 639 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 GUCY2FP51841 1108 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 YARSP54577 528 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 GJA9P57773 515 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 RBP5P82980 135 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ADCY1Q08828 1119 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 SNX17Q15036 470 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 C2CD6Q53TS8 623 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CYP4F22Q6NT55 531 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 MAATS1Q7Z4T9 603 aa8.18□□□□□ -1.1
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CS-204ENST00000546621 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 HPDLQ96IR7 371 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 SNX27Q96L92 541 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 SDCBP2Q9H190 292 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
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CS-204ENST00000546621 SMYD3Q9H7B4 428 aa8.18□□□□□ -1.1
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CS-204ENST00000546621 VCX3AQ9NNX9 186 aa8.18□□□□□ -1.1
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CS-204ENST00000546621 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 GALNT8Q9NY28 637 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 DPP3Q9NY33 737 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 SNTG2Q9NY99 539 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 GABRQQ9UN88 632 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 AGAP1Q9UPQ3 857 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 C5orf60A6NFR6 353 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 E7ENQ6 273 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 MED7O43513 233 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CILPO75339 1184 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 GLI1P08151 1106 aa8.17□□□□□ -1.1
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CS-204ENST00000546621 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ITGA4P13612 1032 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 SCTRP47872 440 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 FLT3LGP49771 235 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 RAD23BP54727 409 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CDH8P55286 799 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 HDAC4P56524 1084 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 MXRA7P84157 204 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 GUCY2DQ02846 1103 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 SULT2A1Q06520 285 aa8.17□□□□□ -1.1
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