RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520945.5

STAU2-209, Transcript of staufen double-stranded RNA binding protein 2, human

TSL 4

Gene STAU2, Length 472 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STAU2-209	ENST00000520945	MKS1	Q9NXB0	559 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	HACD3	Q9P035	362 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	SLAIN2	Q9P270	581 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		4.08	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	CHD4	Q14839	1912 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	SLIT3	O75094	1523 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	USP6	P35125	1406 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	COL15A1	P39059	1388 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	UBE4B	O95155	1302 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945		B8ZZF3	427 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945		H0YJX3	145 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945		K7EPI3	171 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	VWA5A	O00534	786 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	RGS13	O14921	159 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	HAT1	O14929	419 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	SPINT1	O43278	529 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	AQP9	O43315	295 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	SPOP	O43791	374 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	SERPINI2	O75830	405 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	TOMM70	O94826	608 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	KLHL2	O95198	593 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	BMP10	O95393	424 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	TFAP2A	P05549	437 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	COL6A2	P12110	1019 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	ITGA4	P13612	1032 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	KRT10	P13645	584 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	GFAP	P14136	432 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	PDE6A	P16499	860 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	CASP1	P29466	404 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	SLC5A2	P31639	672 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	SLC16A2	P36021	539 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	GRIA2	P42262	883 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	ALDH1A3	P47895	512 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	TNNI2	P48788	182 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	ENTPD1	P49961	510 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	ZNF132	P52740	706 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	SLC5A3	P53794	718 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	AQP4	P55087	323 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	CTAG1A	P78358	180 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	RELB	Q01201	579 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	BTK	Q06187	659 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	CDK18	Q07002	472 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	TFCP2	Q12800	502 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	PTK7	Q13308	1070 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	APOF	Q13790	326 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	DPYS	Q14117	519 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	ZNF174	Q15697	407 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	KCNJ8	Q15842	424 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	DGKD	Q16760	1214 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	USP41	Q3LFD5	358 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	ZBED5	Q49AG3	693 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	SFT2D3	Q587I9	215 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	MIIP	Q5JXC2	388 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	RAPH1	Q70E73	1250 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	TMC7	Q7Z402	723 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		4.07	□□□□□ -1.76
STAU2-209	ENST00000520945	AKAP14	Q86UN6	197 aa		4.07	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms