RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 PLS1Q14651 629 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRK-202ENST00000368205 MIDNQ504T8 468 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRK-202ENST00000368205 C10orf25Q5T742 122 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRK-202ENST00000368205 SPATA3Q8NHX4 192 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRK-202ENST00000368205 CIPCQ9C0C6 399 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRK-202ENST00000368205 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRK-202ENST00000368205 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRK-202ENST00000368205 BTBD19C9JJ37 291 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRK-202ENST00000368205 DSCR3O14972 297 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRK-202ENST00000368205 OAZ2O95190 189 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRK-202ENST00000368205 CYP2C9P11712 490 aa4.94□□□□□ -1.62
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PTPRK-202ENST00000368205 SATB1Q01826 763 aa4.94□□□□□ -1.62
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PTPRK-202ENST00000368205 CYP1B1Q16678 543 aa4.94□□□□□ -1.62
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PTPRK-202ENST00000368205 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa4.94□□□□□ -1.62
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PTPRK-202ENST00000368205 CXorf36Q9H7Y0 433 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRK-202ENST00000368205 XPR1Q9UBH6 696 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRK-202ENST00000368205 SCRIBQ14160 1630 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRK-202ENST00000368205 A1BGP04217 495 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-202ENST00000368205 WNT3P56703 355 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-202ENST00000368205 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.62
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PTPRK-202ENST00000368205 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-202ENST00000368205 OSCP1Q8WVF1 389 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRK-202ENST00000368205 E2F1Q01094 437 aa4.92□□□□□ -1.62
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PTPRK-202ENST00000368205 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
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PTPRK-202ENST00000368205 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-202ENST00000368205 MED16Q9Y2X0 877 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-202ENST00000368205 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-202ENST00000368205 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-202ENST00000368205 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
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PTPRK-202ENST00000368205 IZUMO1Q8IYV9 350 aa4.91□□□□□ -1.62
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PTPRK-202ENST00000368205 TMX2Q9Y320 296 aa4.9□□□□□ -1.63
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PTPRK-202ENST00000368205 ABLIM3O94929 683 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-202ENST00000368205 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
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