RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa29.35■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 OLIG1Q8TAK6 271 aa29.35■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 CEP295NLQ96MC4 621 aa29.35■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 PCDHB18PQ96TA0 734 aa29.35■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM30AQ9NV96 361 aa29.35■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 YIPF1Q9Y548 306 aa29.35■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 INSL5Q9Y5Q6 135 aa29.35■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP29.34■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 IGFBP4P22692 258 aa29.34■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 ALDH1A3P47895 512 aa29.34■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 PLD1Q13393 1074 aa29.34■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa29.34■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM139Q8IV31 216 aa29.34■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 ZMIZ2Q8NF64 920 aa29.34■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 SLC30A5Q8TAD4 765 aa29.34■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 SLC7A14Q8TBB6 771 aa29.34■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 STK32AQ8WU08 396 aa29.34■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 MAN1C1Q9NR34 630 aa29.34■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 C8AP07357 584 aa29.34■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 UNGP13051 313 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 EPCAMP16422 314 aa29.34■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 KIF11P52732 1056 aa29.34■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 ADGRE1Q14246 886 aa29.34■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 SLC18A3Q16572 532 aa29.34■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 NAA35Q5VZE5 725 aa29.34■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 GZMAP12544 262 aa29.33■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 DDR2Q16832 855 aa29.33■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 PIGZQ86VD9 579 aa29.33■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 WDTC1Q8N5D0 677 aa29.33■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 MSANTD4Q8NCY6 345 aa29.33■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 SPATA17Q96L03 361 aa29.33■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 HSFY1Q96LI6 401 aa29.33■■■□□ 2.29
GIPC1-201ENST00000345425 A0A087X0T9 212 aa29.32■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 SOAT2O75908 522 aa29.32■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 FAM228BP0C875 321 aa29.32■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 NSFP46459 744 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 CENPCQ03188 943 aa29.32■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 PDCLQ13371 301 aa29.32■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 LLGL2Q6P1M3 1020 aa29.32■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 IGFLR1Q9H665 355 aa29.32■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 CYLDQ9NQC7 956 aa29.32■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 SOWAHDA6NJG2 315 aa29.31■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 TULP2O00295 520 aa29.31■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 SRGAP2BP0DMP2 458 aa29.31■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 SNX16P57768 344 aa29.31■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 HYAL1Q12794 435 aa29.31■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 PMF1Q6P1K2 205 aa29.31■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 CPA5Q8WXQ8 436 aa29.31■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 KCTD13Q8WZ19 329 aa29.31■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 CASP10Q92851 521 aa29.31■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 ST7Q9NRC1 585 aa29.31■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 LRG1P02750 347 aa29.31■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 ATF6P18850 670 aa29.31■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 ACADSBP45954 432 aa29.31■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 GPR15P49685 360 aa29.31■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 EPHB3P54753 998 aa29.31■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 TWF1Q12792 350 aa29.31■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 KCNC3Q14003 757 aa29.31■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 VEPH1Q14D04 833 aa29.31■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 PPM1LQ5SGD2 360 aa29.31■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 EFHBQ8N7U6 833 aa29.31■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 CYTH4Q9UIA0 394 aa29.31■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 NAGPAQ9UK23 515 aa29.31■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 PATJQ8NI35 1801 aa29.3■■■□□ 2.28
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GIPC1-201ENST00000345425 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 ACAD10Q6JQN1 1059 aa29.3■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 ERICH1Q86X53 443 aa29.3■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa29.3■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 MIS12Q9H081 205 aa29.3■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 LRRC4Q9HBW1 653 aa29.3■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
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GIPC1-201ENST00000345425 ZMYND10O75800 440 aa29.29■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 HOXA9P31269 272 aa29.29■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP29.29■■■□□ 2.28
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GIPC1-201ENST00000345425 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa29.29■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 Q7L0L9 218 aa29.29■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 NUP93Q8N1F7 819 aa29.29■■■□□ 2.28
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GIPC1-201ENST00000345425 DZANK1Q9NVP4 752 aa29.29■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 ARHGAP6O43182 974 aa29.29■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 NCK2O43639 380 aa29.29■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 RTN2O75298 545 aa29.29■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 RPL34P49207 117 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 SLC5A3P53794 718 aa29.29■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC122Q5T0U0 273 aa29.29■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 ELMOD1Q8N336 334 aa29.29■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 DEFB123Q8N688 67 aa29.29■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 SYNCQ9H7C4 482 aa29.29■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa29.29■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 EHD2Q9NZN4 543 aa29.29■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 ASB3Q9Y575 518 aa29.29■■■□□ 2.28
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