RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
SPCS1-201ENST00000233025 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa17.71■□□□□ 0.43
SPCS1-201ENST00000233025 SPATA18Q8TC71 538 aa17.71■□□□□ 0.43
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
SPCS1-201ENST00000233025 MYRFLQ96LU7 910 aa17.71■□□□□ 0.43
SPCS1-201ENST00000233025 PNKPQ96T60 521 aa17.71■□□□□ 0.43
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM60Q9H2L4 133 aa17.71■□□□□ 0.43
SPCS1-201ENST00000233025 IL21RQ9HBE5 538 aa17.71■□□□□ 0.43
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa17.71■□□□□ 0.43
SPCS1-201ENST00000233025 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 NOL4O94818 638 aa17.7■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 CTDNEP1O95476 244 aa17.7■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 APODP05090 189 aa17.7■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP17.7■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 DBX2Q6ZNG2 339 aa17.7■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC15Q8TF66 581 aa17.7■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 HAPLN2Q9GZV7 340 aa17.7■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 BHMT2Q9H2M3 363 aa17.7■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa17.7■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 TMLHEQ9NVH6 421 aa17.7■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 MYH10P35580 1976 aa17.7■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 MYO9AB2RTY4 2548 aa17.69■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 C2orf78A6NCI8 922 aa17.69■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 MYMKA6NI61 221 aa17.69■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 XBP1P17861 261 aa17.69■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 MCL1Q07820 350 aa17.69■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 RGL4Q8IZJ4 473 aa17.69■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 PHTF2Q8N3S3 785 aa17.69■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 KIF2CQ99661 725 aa17.69■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 CDC6Q99741 560 aa17.69■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 CD248Q9HCU0 757 aa17.69■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 DSEQ9UL01 958 aa17.69■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 CYP8B1Q9UNU6 501 aa17.69■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 LACTBL1A8MY62 500 aa17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 XPOTO43592 962 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 PFKFB2O60825 505 aa17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 CILPO75339 1184 aa17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 CDKL5O76039 1030 aa17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 CLTAP09496 248 aa17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 HLA-EP13747 358 aa17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 GNSP15586 552 aa17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 PAX3P23760 479 aa17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 TNFSF9P41273 254 aa17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 GRIA2P42262 883 aa17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 TNFRSF4P43489 277 aa17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 KDSRQ06136 332 aa17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 PPP2R3AQ06190 1150 aa17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 DHCR24Q15392 516 aa17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 ECM1Q16610 540 aa17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 SPATA1Q5VX52 437 aa17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 C9orf57Q5W0N0 161 aa17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 GPR155Q7Z3F1 870 aa17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 NXPE2Q96DL1 559 aa17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 CD93Q9NPY3 652 aa17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 KMT5AQ9NQR1 393 aa17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGEF4Q9NR80 690 aa17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 TM7SF3Q9NS93 570 aa17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 FLNCQ14315 2725 aa17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 PLK4O00444 970 aa17.67■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 PIRO00625 290 aa17.67■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 FLRT2O43155 660 aa17.67■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF217O75362 1048 aa17.67■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 MUTP22033 750 aa17.67■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 MAOBP27338 520 aa17.67■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 KRT2P35908 639 aa17.67■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 BNC1Q01954 994 aa17.67■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 RESTQ13127 1097 aa17.67■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 MAPK7Q13164 816 aa17.67■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 KCNB1Q14721 858 aa17.67■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 PTPRNQ16849 979 aa17.67■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa17.67■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa17.67■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 GAREM1Q9H706 876 aa17.67■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 IGSF5Q9NSI5 407 aa17.67■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 DACH1Q9UI36 760 aa17.67■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 DNMT3LQ9UJW3 386 aa17.67■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa17.67■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1B0GTW7 788 aa17.66■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PQF6 199 aa17.66■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 ANO9A1A5B4 782 aa17.66■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 GOLGA8CPA6NN73 597 aa17.66■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 LEFTY2O00292 366 aa17.66■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 HIP1RO75146 1068 aa17.66■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 CER1O95813 267 aa17.66■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 ADRB2P07550 413 aa17.66■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 NDUFV2P19404 249 aa17.66■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 KCNC4Q03721 635 aa17.66■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 DDR2Q16832 855 aa17.66■□□□□ 0.42
SPCS1-201ENST00000233025 SYCP2LQ5T4T6 812 aa17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms