RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W YKL070WP36087 169 aa8.22□□□□□ -1.09
PRP4YPR178W ATX1P38636 73 aa8.22□□□□□ -1.09
PRP4YPR178W YHL037CP38733 133 aa8.22□□□□□ -1.09
PRP4YPR178W TOS6P48560 102 aa8.22□□□□□ -1.09
PRP4YPR178W SED1Q01589 338 aa8.22□□□□□ -1.09
PRP4YPR178W YPL261CQ08976 102 aa8.22□□□□□ -1.09
PRP4YPR178W NHP2P32495 156 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PRP4YPR178W MOH1P38191 138 aa8.22□□□□□ -1.09
PRP4YPR178W RPL32P38061 130 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PRP4YPR178W JID1Q12350 301 aa8.21□□□□□ -1.1
PRP4YPR178W HMRA2P0CY13 119 aa8.2□□□□□ -1.1
PRP4YPR178W MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PRP4YPR178W YNL234WP53857 426 aa8.2□□□□□ -1.1
PRP4YPR178W DIA1P54005 336 aa8.2□□□□□ -1.1
PRP4YPR178W COA3Q3E7B2 85 aa8.2□□□□□ -1.1
PRP4YPR178W VAR1P02381 398 aa8.19□□□□□ -1.1
PRP4YPR178W OST2P46964 130 aa8.19□□□□□ -1.1
PRP4YPR178W YGR045CP53229 120 aa8.19□□□□□ -1.1
PRP4YPR178W MSA1Q08471 629 aa8.19□□□□□ -1.1
PRP4YPR178W YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PRP4YPR178W HFA1P32874 2273 aa8.18□□□□□ -1.1
PRP4YPR178W INO4P13902 151 aa8.18□□□□□ -1.1
PRP4YPR178W IES6P32617 166 aa8.18□□□□□ -1.1
PRP4YPR178W KTI12P34253 313 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PRP4YPR178W OXA1P39952 402 aa8.18□□□□□ -1.1
PRP4YPR178W SPI1P40092 148 aa8.18□□□□□ -1.1
PRP4YPR178W WSC3Q12215 556 aa8.18□□□□□ -1.1
PRP4YPR178W PRE3P38624 215 aa8.17□□□□□ -1.1
PRP4YPR178W YER121WP40076 114 aa8.17□□□□□ -1.1
PRP4YPR178W YNL217WP40152 326 aa8.17□□□□□ -1.1
PRP4YPR178W YNR077CP53758 84 aa8.17□□□□□ -1.1
PRP4YPR178W IRC23Q08416 157 aa8.17□□□□□ -1.1
PRP4YPR178W YEL067CP39978 195 aa8.16□□□□□ -1.1
PRP4YPR178W HPA2Q06592 156 aa8.16□□□□□ -1.1
PRP4YPR178W YOL160WQ08321 113 aa8.16□□□□□ -1.1
PRP4YPR178W IGO2Q9P305 131 aa8.16□□□□□ -1.1
PRP4YPR178W AGA1P32323 725 aa8.15□□□□□ -1.1
PRP4YPR178W LSM6Q06406 86 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PRP4YPR178W SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W ISD11Q6Q560 94 aa8.14□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W YDL022C-AP0C5L6 82 aa8.13□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W POR2P40478 281 aa8.13□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W YFR057WP43625 151 aa8.13□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W PBP4Q07362 185 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W LCB3P47013 409 aa8.12□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W GLO1P50107 326 aa8.12□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W YNL092WP53934 400 aa8.12□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W YMR181CQ03231 154 aa8.12□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W FCY1Q12178 158 aa8.12□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W YOR008C-AQ3E7B9 74 aa8.12□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa8.11□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W YCR075W-AQ3E830 75 aa8.11□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W COX10P21592 462 aa8.1□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W URM1P40554 99 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W YFL065CP43539 102 aa8.1□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W YAR1P46683 200 aa8.1□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W YIP3P53633 176 aa8.1□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W YNL184CP53876 108 aa8.1□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W AIM11P87275 137 aa8.1□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W YPR203WQ08994 102 aa8.1□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W MET32Q12041 191 aa8.1□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W PHO85P17157 305 aa8.1□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W DUO1P53168 247 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W YGR219WP53307 113 aa8.1□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W YLR194CQ05777 254 aa8.1□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W SNA4Q07549 140 aa8.1□□□□□ -1.11
PRP4YPR178W RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PRP4YPR178W RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PRP4YPR178W COX17Q12287 69 aa8.08□□□□□ -1.12
PRP4YPR178W CCW14O13547 238 aa8.07□□□□□ -1.12
PRP4YPR178W VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data8.07□□□□□ -1.12not detected
PRP4YPR178W YER085CP40058 173 aa8.07□□□□□ -1.12
PRP4YPR178W AIM34Q03673 198 aa8.07□□□□□ -1.12
PRP4YPR178W MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PRP4YPR178W RPA12P32529 125 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PRP4YPR178W YOR304C-AO14468 76 aa8.05□□□□□ -1.12
PRP4YPR178W MIC12P38341 106 aa8.04□□□□□ -1.12
PRP4YPR178W VHS2P40463 436 aa8.04□□□□□ -1.12
PRP4YPR178W WWM1P43582 211 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PRP4YPR178W DCV1P43595 202 aa8.03□□□□□ -1.12
PRP4YPR178W KEG1P43614 200 aa8.03□□□□□ -1.12
PRP4YPR178W RRG8Q06109 277 aa8.03□□□□□ -1.12
PRP4YPR178W ATP15P21306 62 aa8.02□□□□□ -1.13
PRP4YPR178W SUT1P53032 299 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PRP4YPR178W EOS1P53938 366 aa8.02□□□□□ -1.13
PRP4YPR178W MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data8.02□□□□□ -1.13not detected
PRP4YPR178W YBR200W-AQ3E755 54 aa8.02□□□□□ -1.13
PRP4YPR178W YHR022CP38763 256 aa8.01□□□□□ -1.13
PRP4YPR178W ERF2Q06551 359 aa8.01□□□□□ -1.13
PRP4YPR178W KRE1P17260 313 aa8□□□□□ -1.13
PRP4YPR178W BNA1P47096 177 aa8□□□□□ -1.13
PRP4YPR178W YJR146WP47174 117 aa8□□□□□ -1.13
PRP4YPR178W YGR025WP53216 100 aa8□□□□□ -1.13
PRP4YPR178W NCE103P53615 221 aa8□□□□□ -1.13
PRP4YPR178W CCW12Q12127 133 aa8□□□□□ -1.13
PRP4YPR178W PRM7Q12459 698 aa8□□□□□ -1.13
PRP4YPR178W YCR085WP25650 117 aa7.99□□□□□ -1.13
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