RNA–Protein interactions for RNA: YOR116C

RPO31, Transcript of RNA polymerase III largest subunit C160, yeast

Gene RPO31, Length 4,383 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPO31	YOR116C	MBB1	P39534	108 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPO31	YOR116C	YER076C	P40049	302 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPO31	YOR116C	GRE1	Q08969	168 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPO31	YOR116C	ENV10	Q99382	181 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPO31	YOR116C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
RPO31	YOR116C	QRI5	P32344	111 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPO31	YOR116C	VMA11	P32842	164 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPO31	YOR116C	FHN1	P53279	174 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPO31	YOR116C	YHP1	Q04116	353 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPO31	YOR116C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPO31	YOR116C	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
RPO31	YOR116C	LTP1	P40347	161 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPO31	YOR116C	PRM5	P40476	318 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPO31	YOR116C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
RPO31	YOR116C	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.89
RPO31	YOR116C	EGT2	P42835	1041 aa		3.21	□□□□□ -1.89
RPO31	YOR116C	MRPS8	Q03799	155 aa		3.21	□□□□□ -1.89
RPO31	YOR116C	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		3.21	□□□□□ -1.89
RPO31	YOR116C	SWD3	P38123	315 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YEL068C	P39977	110 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YNL195C	P40168	261 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	DCV1	P43595	202 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	IRC23	Q08416	157 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YDR215C	Q12240	137 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	RPS23B	P0CX30	145 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YGL235W	P53071	178 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	ROX3	P25046	220 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YGR045C	P53229	120 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	CRH1	P53301	507 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YHR139C-A	O13536	103 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	MRPL16	P38064	232 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	LST8	P41318	303 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YLR281C	Q05863	155 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	FIT2	Q08906	153 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	PRM7	Q12459	698 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YOR343C	Q12484	108 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	AHT1	P29589	182 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	POR2	P40478	281 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YGR050C	P53231	118 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YOR314W	Q12506	109 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YLR358C	O13565	187 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	MPC2	P38857	129 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	SIP18	P50263	79 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	HAL1	Q01766	294 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	CUP1-1	P0CX80	61 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	CUP1-2	P0CX81	61 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	UBC4	P15731	148 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	HST4	P53688	370 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	IZH3	Q07959	543 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	BNA1	P47096	177 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	NCE103	P53615	221 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	RPP1	P38786	293 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YAR029W	P39549	74 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YMR141C	P40211	102 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	DMA2	P53924	522 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	OM14	P38325	134 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.18	□□□□□ -1.9	not detected
RPO31	YOR116C	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YKL102C	P34249	101 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	SNA2	P56508	79 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	TOM6	P33448	61 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YLR296W	Q05898	108 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	HSP150	P32478	413 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	HUB1	Q6Q546	73 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	FZF1	P32805	299 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YBR144C	P34215	104 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	CIS3	P47001	227 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YNL198C	P40166	100 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	TOM7	P53507	60 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	BSC1	Q12140	328 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	COA2	Q3E823	68 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	DIF1	O13577	133 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YCR050C	P25630	102 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	YIR020C	P40575	100 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	PFY1	P07274	126 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPO31	YOR116C	SFT1	P43682	97 aa		3.16	□□□□□ -1.9

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.2 ms