RNA–Protein interactions for RNA: YLR467W

YRF1-5, Transcript of Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, yeast

Gene YRF1-5, Length 5,391 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YRF1-5	YLR467W	LCB3	P47013	409 aa		6.31	□□□□□ -1.4
YRF1-5	YLR467W	PCP1	P53259	346 aa		6.31	□□□□□ -1.4
YRF1-5	YLR467W	HST4	P53688	370 aa		6.31	□□□□□ -1.4
YRF1-5	YLR467W	TIM22	Q12328	207 aa		6.3	□□□□□ -1.4
YRF1-5	YLR467W	RNH203	Q12338	110 aa		6.3	□□□□□ -1.4
YRF1-5	YLR467W	INO2	P26798	304 aa		6.3	□□□□□ -1.4
YRF1-5	YLR467W	MRPL19	P53875	158 aa		6.3	□□□□□ -1.4
YRF1-5	YLR467W	API2	Q04413	109 aa		6.3	□□□□□ -1.4
YRF1-5	YLR467W	KRE1	P17260	313 aa		6.3	□□□□□ -1.4
YRF1-5	YLR467W	YFL051C	P43552	160 aa		6.3	□□□□□ -1.4
YRF1-5	YLR467W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
YRF1-5	YLR467W	PFY1	P07274	126 aa		6.3	□□□□□ -1.4
YRF1-5	YLR467W	ECO1	P43605	281 aa		6.3	□□□□□ -1.4
YRF1-5	YLR467W	PBA1	Q05778	276 aa		6.3	□□□□□ -1.4
YRF1-5	YLR467W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		6.3	□□□□□ -1.4
YRF1-5	YLR467W	VMA11	P32842	164 aa		6.29	□□□□□ -1.4
YRF1-5	YLR467W	EMC6	Q12431	108 aa		6.29	□□□□□ -1.4
YRF1-5	YLR467W	LTP1	P40347	161 aa		6.29	□□□□□ -1.4
YRF1-5	YLR467W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
YRF1-5	YLR467W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		6.29	□□□□□ -1.4
YRF1-5	YLR467W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
YRF1-5	YLR467W	YMR141C	P40211	102 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YRF1-5	YLR467W	PHO85	P17157	305 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YRF1-5	YLR467W	NRG2	P38082	220 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YRF1-5	YLR467W	RRG8	Q06109	277 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YRF1-5	YLR467W	YDR114C	Q04597	100 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YRF1-5	YLR467W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	GLO1	P50107	326 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	BLM10	P43583	2143 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	YHL042W	P38729	150 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	PET8	P38921	284 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	YLR415C	O13578	112 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	AQY1	P0CD91	305 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	YCR022C	P25620	114 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	YPL229W	Q99395	206 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	YKR032W	P36127	104 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	YHR139C-A	O13536	103 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	SIP18	P50263	79 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	KEG1	P43614	200 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	MIC12	P38341	106 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	PIR5	P46999	287 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	YGR018C	P53211	109 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	MSA1	Q08471	629 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	YCH1	P42937	148 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	MID2	P36027	376 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	GLE2	P40066	365 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	TOS6	P48560	102 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	MGR2	Q02889	113 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	AIM19	P40502	157 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	SUN4	P53616	420 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	RXT3	Q07458	294 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	YLR112W	Q12130	139 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	YER121W	P40076	114 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	AIM34	Q03673	198 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	PEX17	P40155	199 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	YIA6	P40556	373 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	CCW14	O13547	238 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	YER084W	P40057	128 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	RPB10	P22139	70 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	SBH2	P52871	88 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YRF1-5	YLR467W	LDB16	P25587	256 aa		6.21	□□□□□ -1.42
YRF1-5	YLR467W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
YRF1-5	YLR467W	HUR1	P45820	110 aa		6.21	□□□□□ -1.42
YRF1-5	YLR467W	YCR006C	P25350	157 aa		6.2	□□□□□ -1.42
YRF1-5	YLR467W	COA3	Q3E7B2	85 aa		6.2	□□□□□ -1.42
YRF1-5	YLR467W	ATP15	P21306	62 aa		6.2	□□□□□ -1.42
YRF1-5	YLR467W	ERF2	Q06551	359 aa		6.2	□□□□□ -1.42
YRF1-5	YLR467W	YDL009C	Q12210	107 aa		6.19	□□□□□ -1.42
YRF1-5	YLR467W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
YRF1-5	YLR467W	YLR042C	Q07990	161 aa		6.19	□□□□□ -1.42
YRF1-5	YLR467W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
YRF1-5	YLR467W	RPS23B	P0CX30	145 aa		6.19	□□□□□ -1.42
YRF1-5	YLR467W	VPS55	P47111	140 aa		6.19	□□□□□ -1.42
YRF1-5	YLR467W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
YRF1-5	YLR467W	TOM6	P33448	61 aa		6.18	□□□□□ -1.42
YRF1-5	YLR467W	SMP1	P38128	452 aa		6.18	□□□□□ -1.42
YRF1-5	YLR467W	MTC6	P38849	526 aa		6.18	□□□□□ -1.42
YRF1-5	YLR467W	TRP1	P00912	224 aa		6.18	□□□□□ -1.42
YRF1-5	YLR467W	SBH1	P52870	82 aa		6.18	□□□□□ -1.42
YRF1-5	YLR467W	YNR077C	P53758	84 aa		6.18	□□□□□ -1.42
YRF1-5	YLR467W	COX12	Q01519	83 aa		6.18	□□□□□ -1.42
YRF1-5	YLR467W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
YRF1-5	YLR467W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
YRF1-5	YLR467W	KTI11	Q3E840	82 aa		6.17	□□□□□ -1.42
YRF1-5	YLR467W	YHR213W	P0CI67	198 aa		6.17	□□□□□ -1.42
YRF1-5	YLR467W	MPC2	P38857	129 aa		6.17	□□□□□ -1.42
YRF1-5	YLR467W	DCV1	P43595	202 aa		6.17	□□□□□ -1.42
YRF1-5	YLR467W	YBR209W	P38311	105 aa		6.16	□□□□□ -1.42
YRF1-5	YLR467W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		6.16	□□□□□ -1.42
YRF1-5	YLR467W	YSY6	P38374	65 aa		6.16	□□□□□ -1.42

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 72.2 ms