RNA–Protein interactions for RNA: YLL019C

KNS1, Transcript of Protein kinase involved in negative regulation of PolIII transcription, yeast

Gene KNS1, Length 2,214 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KNS1	YLL019C	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		5.25	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		5.25	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	YAL064W-B	O13512	126 aa		5.25	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	PHO85	P17157	305 aa		5.25	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	ROX3	P25046	220 aa		5.25	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	HUA1	P40325	198 aa		5.25	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	YIL059C	P40520	121 aa		5.25	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	LST8	P41318	303 aa		5.25	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	SUN4	P53616	420 aa		5.25	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	UBC7	Q02159	165 aa		5.25	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	API2	Q04413	109 aa		5.25	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	VMA11	P32842	164 aa		5.24	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	SWS2	P53937	143 aa		5.24	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	YOR376W	Q08900	122 aa		5.24	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		5.24	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	5.24	□□□□□ -1.57	RIP-Chip
KNS1	YLL019C	PRY1	P47032	299 aa		5.24	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	YPS5	P53057	165 aa		5.24	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	ENV10	Q99382	181 aa		5.24	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	HSP150	P32478	413 aa		5.23	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	YIP1	P53039	248 aa		5.23	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	IMP1	P28627	190 aa		5.23	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	YER039C-A	P0CD97	72 aa		5.22	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	PET8	P38921	284 aa		5.22	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	IGO2	Q9P305	131 aa		5.22	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	YCR085W	P25650	117 aa		5.21	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	FPR2	P32472	135 aa		5.21	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	YFL015C	P43578	164 aa		5.21	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	NCA3	P46955	337 aa		5.21	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	UPS1	Q05776	175 aa		5.21	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		5.21	□□□□□ -1.57
KNS1	YLL019C	SPS100	P13130	326 aa		5.21	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	YCR006C	P25350	157 aa		5.21	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	INO2	P26798	304 aa		5.21	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	YCR041W	P37265	110 aa		5.21	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	YMR320W	Q04897	101 aa		5.21	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	ECM12	O13529	151 aa		5.2	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	MID2	P36027	376 aa		5.2	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	GLE2	P40066	365 aa		5.2	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	COX12	Q01519	83 aa		5.2	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	YLR112W	Q12130	139 aa		5.2	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	FCY1	Q12178	158 aa		5.2	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	GPI18	P38211	433 aa		5.19	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	RPS27B	P38711	82 aa		5.19	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	YNL217W	P40152	326 aa		5.19	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	LCB3	P47013	409 aa		5.19	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	CAX4	P53223	239 aa		5.19	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	YPL261C	Q08976	102 aa		5.19	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	UBC5	P15732	148 aa		5.19	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	YKR032W	P36127	104 aa		5.19	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	YEL067C	P39978	195 aa		5.19	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	FIP1	P45976	327 aa		5.19	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	YNR077C	P53758	84 aa		5.19	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	DAD4	P69851	72 aa		5.19	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		5.19	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	NRG2	P38082	220 aa		5.18	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	KNH1	P50112	268 aa		5.18	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	HST4	P53688	370 aa		5.17	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	YDR029W	Q12111	104 aa		5.17	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	DAD1	Q12248	94 aa		5.17	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	MGR2	Q02889	113 aa		5.17	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	YHR140W	P38842	239 aa		5.16	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	PEX22	P39718	180 aa		5.16	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	YMR317W	Q04893	1140 aa		5.16	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	AQY1	P0CD91	305 aa		5.16	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	YKR073C	P36153	106 aa		5.16	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	YHL042W	P38729	150 aa		5.16	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	MIX14	Q04341	121 aa		5.16	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	YHR139C-A	O13536	103 aa		5.15	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	Q0255	P03881	472 aa		5.15	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	DSE2	P38844	325 aa		5.15	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	CIS3	P47001	227 aa		5.15	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	VPS55	P47111	140 aa		5.15	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	GPI19	Q04082	140 aa		5.15	□□□□□ -1.58
KNS1	YLL019C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		5.15	□□□□□ -1.59
KNS1	YLL019C	HMRA2	P0CY13	119 aa		5.14	□□□□□ -1.59
KNS1	YLL019C	YMR141C	P40211	102 aa		5.14	□□□□□ -1.59
KNS1	YLL019C	SBH1	P52870	82 aa		5.14	□□□□□ -1.59
KNS1	YLL019C	ATP23	P53722	227 aa		5.14	□□□□□ -1.59
KNS1	YLL019C	SPG4	Q04438	115 aa		5.14	□□□□□ -1.59
KNS1	YLL019C	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
KNS1	YLL019C	PFY1	P07274	126 aa		5.13	□□□□□ -1.59
KNS1	YLL019C	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		5.13	□□□□□ -1.59
KNS1	YLL019C	YCR022C	P25620	114 aa		5.13	□□□□□ -1.59
KNS1	YLL019C	MED6	P38782	295 aa		5.13	□□□□□ -1.59

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 42.3 ms