RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W YER078W-AQ3E7A2 54 aa3.09□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa3.09□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W ENV10Q99382 181 aa3.09□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W CDC39P25655 2108 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W UBC5P15732 148 aa3.08□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W IRC25Q07951 179 aa3.08□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W YDR029WQ12111 104 aa3.08□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W DFM1Q12743 341 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W YPR108W-AQ3E7B3 70 aa3.08□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W FLO9P39712 1322 aa3.08□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W YKL044WP36092 106 aa3.08□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W YKR041WP36134 250 aa3.08□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W PRS4P38063 326 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W YER181CP40097 107 aa3.08□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W FCF1Q05498 189 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W YOL029CQ08187 201 aa3.08□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W TIM18Q08749 192 aa3.08□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W FIT3Q08907 204 aa3.08□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W APS1P35181 156 aa3.07□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W AIM34Q03673 198 aa3.07□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W MPD1Q12404 318 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W YDR119W-AQ2V2P9 66 aa3.07□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W YCR085WP25650 117 aa3.07□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W YCR041WP37265 110 aa3.07□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W YPL073CP40323 161 aa3.07□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W HUA1P40325 198 aa3.07□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W REE1P40893 198 aa3.07□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W PCP1P53259 346 aa3.07□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W RHO5P53879 331 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W MRX11Q03079 207 aa3.07□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W YFH1Q07540 174 aa3.07□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W RNH203Q12338 110 aa3.07□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W YFL041W-AQ3E817 63 aa3.07□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W ECM12O13529 151 aa3.06□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W ADH5P38113 351 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W HTL1Q9URQ5 78 aa3.06□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W YER079WP40052 210 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W LST8P41318 303 aa3.05□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W ATP19P81451 68 aa3.05□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W YDR042CQ03205 200 aa3.05□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W RAV2Q03956 351 aa3.05□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W YPS3Q12303 508 aa3.05□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W FZF1P32805 299 aa3.05□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W MID2P36027 376 aa3.05□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W UTH1P36135 365 aa3.05□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W NRG2P38082 220 aa3.05□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W SWD3P38123 315 aa3.05□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W CSH1P38287 376 aa3.05□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W YFR045WP43617 309 aa3.05□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W LCB3P47013 409 aa3.05□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W ALG13P53178 202 aa3.05□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W CAX4P53223 239 aa3.05□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W SDC1Q03323 175 aa3.05□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W API2Q04413 109 aa3.05□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W YOR186WQ08560 144 aa3.05□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W RFM1Q12192 310 aa3.05□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W HHF1P02309 103 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W KTI12P34253 313 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W MTC6P38849 526 aa3.04□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W SBH1P52870 82 aa3.04□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W YMR103CQ04436 120 aa3.04□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W PBA1Q05778 276 aa3.04□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W DAD1Q12248 94 aa3.04□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W PIS1P06197 220 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W RPL30P14120 105 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W YFR057WP43625 151 aa3.04□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W GON7P46984 123 aa3.04□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W PGU1P47180 361 aa3.04□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W NRM1P53718 249 aa3.04□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W ABF2Q02486 183 aa3.04□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W COF1Q03048 143 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W RRG8Q06109 277 aa3.04□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W RAF1Q06891 181 aa3.04□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W YPS1P32329 569 aa3.03□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W YHR140WP38842 239 aa3.03□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W PET8P38921 284 aa3.03□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W PAU7P39545 55 aa3.03□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W YEL067CP39978 195 aa3.03□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W VPS55P47111 140 aa3.03□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W HST4P53688 370 aa3.03□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W LSM6Q06406 86 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W YHR214C-DP0CX93 97 aa3.03□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W IMP1P28627 190 aa3.03□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W MRPS5P33759 307 aa3.03□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W GPI18P38211 433 aa3.03□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W DSE2P38844 325 aa3.03□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W YHR173CP38864 112 aa3.03□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W TOM7P53507 60 aa3.03□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W YHP1Q04116 353 aa3.03□□□□□ -1.92
HCA4YJL033W OST1P41543 476 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W FIP1P45976 327 aa3.02□□□□□ -1.93
HCA4YJL033W SKI6P46948 246 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 63.4 ms