RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	TAR1	Q8TGM6	124 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	PCL2	P25693	308 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	YKL102C	P34249	101 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	PAU16	P35994	123 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	MSC3	Q05812	728 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	VMA16	P23968	213 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	YHR140W	P38842	239 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	YJR096W	P47137	282 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	NAT5	Q08689	176 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	YER135C	P40082	130 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	DIA1	P54005	336 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	YIL014C-A	Q02598	104 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	RRG8	Q06109	277 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	PRM3	Q08931	133 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	MIG1	P27705	504 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	AGA1	P32323	725 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	UBC11	P52492	156 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	YDL186W	P48568	277 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	YMR244W	Q04018	355 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	DPP1	Q05521	289 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	CCW12	Q12127	133 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	FYV7	Q12247	151 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	MIG3	P39943	394 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	YFR035C	P43608	114 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	COX16	P47081	118 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	MIC26	P50087	233 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	CNL1	Q06333	122 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	MSA1	Q08471	629 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	YER076C	P40049	302 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	YDL157C	Q12082	118 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YCK1	YHR135C	VAR1	P02381	398 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	SEC11	P15367	167 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	HAC1	P41546	238 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	MRPS8	Q03799	155 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	YPL162C	Q12042	273 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	ATP5	P09457	212 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	AQY1	P0CD91	305 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	YCR023C	P25351	611 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	YGL230C	P53074	147 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	ATP23	P53722	227 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	SAL1	D6W196	494 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	AGE2	P40529	298 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	KEG1	P43614	200 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	SAE3	P89114	91 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	MGR2	Q02889	113 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	TVP18	Q04767	167 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	Q0255	P03881	472 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	PFY1	P07274	126 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	ALG13	P53178	202 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	YDR042C	Q03205	200 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	UTR5	P32630	166 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	PRY2	P36110	329 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	MHR1	Q06630	226 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	HMRA2	P0CY13	119 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	VPS71	Q03433	280 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	YMR103C	Q04436	120 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	YLR042C	Q07990	161 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	YLR112W	Q12130	139 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	YBR144C	P34215	104 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	APS1	P35181	156 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	MPC2	P38857	129 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	RRT13	P40042	185 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	GLO1	P50107	326 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	YDR366C	P87287	132 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YCK1	YHR135C	ELF1	P36053	145 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	VHS2	P40463	436 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YCK1	YHR135C	DCV1	P43595	202 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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