RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538886.5

GGA3-202, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 3,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-202ENST00000538886 TRIM59Q8IWR1 403 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 LINC01465Q8N7H1 131 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 UROC1Q96N76 676 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 PARD6BQ9BYG5 372 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 FBXL5Q9UKA1 691 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 CCDC189A1A4V9 331 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 H3BQF6 201 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 SPTLC1O15269 473 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 CCP110O43303 1012 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 CXCL10P02778 98 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 EPCAMP16422 314 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 PON1P27169 355 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 TWF1Q12792 350 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 REXO1L1PQ8IX06 675 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 OR8K1Q8NGG5 319 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 MIEF2Q96C03 454 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 CD248Q9HCU0 757 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 MAN1C1Q9NR34 630 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 FAM53CQ9NYF3 392 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 TTC36A6NLP5 189 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 GABRR2P28476 465 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 GPNMBQ14956 572 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 CNGA4Q8IV77 575 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 PLEKHO2Q8TD55 490 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 MYLPFQ96A32 169 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 TMEM176AQ96HP8 235 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 DESI2Q9BSY9 194 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 DPP7Q9UHL4 492 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 GUCA1BQ9UMX6 200 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 EFCAB8A8MWE9 144 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 PPP1R37O75864 691 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 CTNNA2P26232 953 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 GSCP56915 257 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 ETF1P62495 437 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 CEP85LQ5SZL2 805 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 SCARA3Q6AZY7 606 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 COLGALT2Q8IYK4 626 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 MAB21L3Q8N8X9 362 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 ADAM32Q8TC27 787 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 KCNK16Q96T55 309 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 NUP58Q9BVL2 599 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 ADAM22Q9P0K1 906 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 TSPAN16Q9UKR8 245 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 FBXL21Q9UKT6 434 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 RLFQ13129 1914 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 SNX16P57768 344 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 DSC3Q14574 896 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 UPP1Q16831 310 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 BMT2Q1RMZ1 405 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 SLC47A2Q86VL8 602 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 CCDC50Q8IVM0 306 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 TMEM35BQ8NCS4 154 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 ARMC2Q8NEN0 867 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 MFSD14AQ96MC6 490 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 PSMB7Q99436 277 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 SELENOOQ9BVL4 669 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 CDH22Q9UJ99 828 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 FAM169AQ9Y6X4 670 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 SOD2P04179 222 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 NCAM1P13591 858 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 TUFMP49411 452 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 NTHL1P78549 312 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 ROR1Q01973 937 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 EFEMP1Q12805 493 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 SCUBE3Q8IX30 993 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 ZNF653Q96CK0 615 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 PTPRHQ9HD43 1115 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 ASAH2Q9NR71 780 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 CNTN3Q9P232 1028 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 STIM2Q9P246 746 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 MYO6Q9UM54 1294 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 ATP8B1O43520 1251 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 SPOPO43791 374 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 MAGEA1P43355 309 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 MTMR3Q13615 1198 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 IQCB1Q15051 598 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 SOWAHAQ2M3V2 549 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-202ENST00000538886 DCAF6Q58WW2 860 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms