RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484281.1

RAB18-205, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, human

TSL 3

Gene RAB18, Length 355 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB18-205	ENST00000484281	MECOM	Q03112	1051 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	SEMA3B	Q13214	749 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	4.69	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	4.69	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	CASC1	Q6TDU7	716 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	PARM1	Q6UWI2	310 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	TEX11	Q8IYF3	940 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	KY	Q8NBH2	561 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	MED8	Q96G25	268 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	SLC32A1	Q9H598	525 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	GP6	Q9HCN6	339 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	COPRS	Q9NQ92	184 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	NUDC	Q9Y266	331 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	FLT1	P17948	1338 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	CACNA1F	O60840	1977 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	FAM149A	A5PLN7	773 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	PDE8B	O95263	885 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	IFNGR1	P15260	489 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	CD247	P20963	164 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	THBS2	P35442	1172 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	CXCL12	P48061	93 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	CBX1	P83916	185 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	CREB5	Q02930	508 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	TLE3	Q04726	772 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	CDSN	Q15517	529 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	GAB3	Q8WWW8	586 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	NUP205	Q92621	2012 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	COL4A2	P08572	1712 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	4.67	□□□□□ -1.66	2e-16	■■■■■ 30.1
RAB18-205	ENST00000484281	DCLK1	O15075	740 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	RNF224	P0DH78	156 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	LAMP2	P13473	410 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	ITGA4	P13612	1032 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	SHMT1	P34896	483 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	PHKA1	P46020	1223 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	TLE1	Q04724	770 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	ICAM4	Q14773	271 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	PLK5	Q496M5	336 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	METTL24	Q5JXM2	366 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	KSR2	Q6VAB6	950 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281		Q6ZS52	159 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	SERINC5	Q86VE9	423 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	MNS1	Q8NEH6	495 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	NKD1	Q969G9	470 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	ALG1	Q9BT22	464 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	DONSON	Q9NYP3	566 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	UBP1	Q9NZI7	540 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	ABCF2	Q9UG63	623 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	GGT7	Q9UJ14	662 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	CLUH	O75153	1309 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	RAD50	Q92878	1312 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB18-205	ENST00000484281	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66

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