RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa20.05■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 VNN1O95497 513 aa20.05■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 FAM163BP0C2L3 166 aa20.05■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 AP3M2P53677 418 aa20.05■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 CDH8P55286 799 aa20.05■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 NCOA4Q13772 614 aa20.05■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 BECN1Q14457 450 aa20.05■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 ZNF699Q32M78 642 aa20.05■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 TXNDC11Q6PKC3 985 aa20.05■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 VSTM1Q6UX27 236 aa20.05■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 CYP2S1Q96SQ9 504 aa20.05■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 SMYD3Q9H7B4 428 aa20.05■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 TRPC7Q9HCX4 862 aa20.05■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 GKN1Q9NS71 199 aa20.05■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 CHRNB1P11230 501 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 CTHP32929 405 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 RAP1GAPP47736 663 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 USP46P62068 366 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 PLCB2Q00722 1185 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 ZNF528Q3MIS6 628 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 WDR44Q5JSH3 913 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 TRIM68Q6AZZ1 485 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 ADSSL1Q8N142 457 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 RIN3Q8TB24 985 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 SPATA17Q96L03 361 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 SLC22A12Q96S37 553 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 CHRDQ9H2X0 955 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 VRTNQ9H8Y1 702 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 SOBPA7XYQ1 873 aa20.03■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 F8VP50 259 aa20.03■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 KIF20AO95235 890 aa20.03■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 LMNAP02545 664 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 ANXA13P27216 316 aa20.03■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 CACNA2D1P54289 1103 aa20.03■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 ZNF667Q5HYK9 610 aa20.03■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 C1orf220Q5T0J3 134 aa20.03■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa20.03■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa20.03■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 TTC16Q8NEE8 873 aa20.03■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 TMC2Q8TDI7 906 aa20.03■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 MSANTD3Q96H12 275 aa20.03■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 FAM83CQ9BQN1 747 aa20.03■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa20.03■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 SDCBP2Q9H190 292 aa20.03■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 SEMA4AQ9H3S1 761 aa20.03■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa20.03■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 C2orf78A6NCI8 922 aa20.02■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 CLDN5O00501 218 aa20.02■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 TRIM66O15016 1216 aa20.02■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 NR2F2P24468 414 aa20.02■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 GAS6Q14393 721 aa20.02■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 KCNB1Q14721 858 aa20.02■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 PON2Q15165 354 aa20.02■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa20.02■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 ZACNQ401N2 412 aa20.02■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 C1orf228Q6PIY5 440 aa20.02■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 SV2AQ7L0J3 742 aa20.02■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa20.02■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 B3GNT5Q9BYG0 378 aa20.02■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 EBF3Q9H4W6 596 aa20.02■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 KIF9Q9HAQ2 790 aa20.02■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 HPS4Q9NQG7 708 aa20.02■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 TMEM30AQ9NV96 361 aa20.02■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 F5P12259 2224 aa20.01■□□□□ 0.79
UPP1-211ENST00000482015 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa20.01■□□□□ 0.79
UPP1-211ENST00000482015 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
UPP1-211ENST00000482015 AKAP3O75969 853 aa20.01■□□□□ 0.79
UPP1-211ENST00000482015 CKMP06732 381 aa20.01■□□□□ 0.79
UPP1-211ENST00000482015 USP17L7P0C7H9 530 aa20.01■□□□□ 0.79
UPP1-211ENST00000482015 FAM160A1Q05DH4 1040 aa20.01■□□□□ 0.79
UPP1-211ENST00000482015 RUNX3Q13761 415 aa20.01■□□□□ 0.79
UPP1-211ENST00000482015 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
UPP1-211ENST00000482015 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa20.01■□□□□ 0.79
UPP1-211ENST00000482015 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
UPP1-211ENST00000482015 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
UPP1-211ENST00000482015 C8orf48Q96LL4 319 aa20.01■□□□□ 0.79
UPP1-211ENST00000482015 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.01■□□□□ 0.79
UPP1-211ENST00000482015 GCNT4Q9P109 453 aa20.01■□□□□ 0.79
UPP1-211ENST00000482015 IKBKBO14920 756 aa20■□□□□ 0.79
UPP1-211ENST00000482015 ARSAP15289 507 aa20■□□□□ 0.79
UPP1-211ENST00000482015 VAMP7P51809 220 aa20■□□□□ 0.79
UPP1-211ENST00000482015 PNOCQ13519 176 aa20■□□□□ 0.79
UPP1-211ENST00000482015 NFIL3Q16649 462 aa20■□□□□ 0.79
UPP1-211ENST00000482015 SPOPLQ6IQ16 392 aa20■□□□□ 0.79
UPP1-211ENST00000482015 Q6ZS52 159 aa20■□□□□ 0.79
UPP1-211ENST00000482015 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
UPP1-211ENST00000482015 CEP295NLQ96MC4 621 aa20■□□□□ 0.79
UPP1-211ENST00000482015 ELOVL4Q9GZR5 314 aa20■□□□□ 0.79
UPP1-211ENST00000482015 PATJQ8NI35 1801 aa19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms