RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SMARCD2Q92925 531 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ELSPBP1Q96BH3 223 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ASIC4Q96FT7 647 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZSWIM3Q96MP5 696 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TWNKQ96RR1 684 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LPIN3Q9BQK8 851 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NT5C1AQ9BXI3 368 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRPV5Q9NQA5 729 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM30AQ9NV96 361 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 COMMD8Q9NX08 183 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HMGXB4Q9UGU5 601 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DUSP12Q9UNI6 340 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CNTN6Q9UQ52 1028 aa11.94□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP11.94□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NCANO14594 1321 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC38A8A6NNN8 435 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRR33A8MZF0 331 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRIM66O15016 1216 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PFKLP17858 780 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ACO1P21399 889 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SP100P23497 879 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CDC25CP30307 473 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GPR15P49685 360 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CACNA2D1P54289 1103 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CETN1Q12798 172 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CUL2Q13617 745 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM78AQ5JUQ0 283 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCDC183Q5T5S1 534 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SNX30Q5VWJ9 437 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MAMSTRQ6ZN01 415 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ACOT1Q86TX2 421 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZMIZ2Q8NF64 920 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 E2F7Q96AV8 911 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MCRS1Q96EZ8 462 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UBXN6Q9BZV1 441 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TASP1Q9H6P5 420 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PNPLA8Q9NP80 782 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CISHQ9NSE2 258 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OBP2AQ9NY56 170 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EHD2Q9NZN4 543 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM63CQ9P1W3 806 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 WNT16Q9UBV4 365 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KIAA1257Q9ULG3 409 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GREB1Q4ZG55 1949 aa11.93□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 WDFY4Q6ZS81 3184 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A0A1W2PRU2 124 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LRRC10BA6NIK2 292 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 F8VP50 259 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TADA3O75528 432 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SRFP11831 508 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MYL4P12829 197 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GABRR2P28476 465 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPP3CCP48454 512 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RAD23BP54727 409 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CYP27A1Q02318 531 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TEAD2Q15562 447 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KLHL40Q2TBA0 621 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CDKAL1Q5VV42 579 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARHGAP17Q68EM7 881 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TANGO2Q6ICL3 276 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MON1AQ86VX9 555 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KIAA1958Q8N8K9 716 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C12orf29Q8N999 325 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC4A11Q8NBS3 891 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GIPC2Q8TF65 315 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RSAD2Q8WXG1 361 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CYFIP2Q96F07 1278 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SMARCD1Q96GM5 515 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARID3AQ99856 593 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC46A2Q9BY10 475 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ATXN3LQ9H3M9 355 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MMRN2Q9H8L6 949 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ANO10Q9NW15 660 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NUMBLQ9Y6R0 609 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DENND4CQ5VZ89 1909 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CLDN5O00501 218 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TCF3P15923 654 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GRIK1P39086 918 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF132P52740 706 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 USP46P62068 366 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FCHO2Q0JRZ9 810 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MAN2A1Q16706 1144 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MIIPQ5JXC2 388 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM31Q5JXX7 168 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms