RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDH9Q9ULB4 789 aa14.09□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
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