RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381570.7

RNF6-202, Transcript of ring finger protein 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RNF6, Length 3,398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6-202ENST00000381570 BCO2Q9BYV7 579 aa6.4□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 CYP3A43Q9HB55 503 aa6.4□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 DNPEPQ9ULA0 475 aa6.4□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 CNTN6Q9UQ52 1028 aa6.4□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 HEY1Q9Y5J3 304 aa6.4□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 GOLGA8KD6RF30 607 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 CLDN5O00501 218 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 PRPSAP2O60256 369 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 TJP3O95049 919 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 CD48P09326 243 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 YY1P25490 414 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 MIPP30301 263 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 PTGIRP43119 386 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 TAF6P49848 677 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 SCNN1GP51170 649 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 PMS2P54278 862 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 CNGA2Q16280 664 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 KCNA10Q16322 511 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 PTGISQ16647 500 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 DUPD1Q68J44 220 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 PMF1Q6P1K2 205 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 FAM228AQ86W67 206 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 XYLT1Q86Y38 959 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 RAET1EQ8TD07 263 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 RUBCNQ92622 972 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 WNT8BQ93098 351 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 ADAM33Q9BZ11 813 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 DCLK3Q9C098 648 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 F5H423 210 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 CYB561D2O14569 222 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 FSCN2O14926 492 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 SPTLC1O15269 473 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 CD4P01730 458 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 DESP17661 470 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 CYP3A5P20815 502 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 GPD2P43304 727 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 ARSEP51690 589 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 ITGA8P53708 1063 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 GNGT1P63211 74 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 HTRA3P83110 453 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 DMTNQ08495 405 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 GPS1Q13098 491 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 MMRN1Q13201 1228 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 MTMR3Q13615 1198 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 SLC29A2Q14542 456 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 SOWAHAQ2M3V2 549 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 P3H1Q32P28 736 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 CCDC38Q502W7 563 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 TTMPQ5BVD1 217 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 TMC3Q7Z5M5 1100 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 CD302Q8IX05 232 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 RCOR2Q8IZ40 523 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 ADGRF2Q8IZF7 708 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 ATL2Q8NHH9 583 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 EXD1Q8NHP7 514 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 CD99L2Q8TCZ2 262 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 GRK7Q8WTQ7 553 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 CLEC4CQ8WTT0 213 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 C9orf72Q96LT7 481 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 ZNF560Q96MR9 790 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 TMEM121Q9BTD3 319 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 RNF186Q9NXI6 227 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 MGAMO43451 1857 aa6.39□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 SIGLEC16A6NMB1 481 aa6.38□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 H7C0C1 242 aa6.38□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 LRCH4O75427 683 aa6.38□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 SHBGP04278 402 aa6.38□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 GPD1P21695 349 aa6.38□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 IL1R2P27930 398 aa6.38□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 TNFRSF8P28908 595 aa6.38□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 ECHS1P30084 290 aa6.38□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 SDC4P31431 198 aa6.38□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 ATP5OP48047 213 aa6.38□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP6.38□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 SLC8A3P57103 927 aa6.38□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 SP3Q02447 781 aa6.38□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 IZUMO3Q5VZ72 239 aa6.38□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 WSCD1Q658N2 575 aa6.38□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 TAF2Q6P1X5 1199 aa6.38□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 TTC30AQ86WT1 665 aa6.38□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 KATNAL2Q8IYT4 538 aa6.38□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 HACE1Q8IYU2 909 aa6.38□□□□□ -1.39
RNF6-202ENST00000381570 CCDC89Q8N998 374 aa6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms