RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 PSMA2P25787 234 aa19.7■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 PHBP35232 272 aa19.7■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa19.7■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 PTPN20Q4JDL3 420 aa19.7■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 TMEM130Q8N3G9 435 aa19.7■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 TMEM35BQ8NCS4 154 aa19.7■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 ZNF398Q8TD17 642 aa19.7■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 FETUBQ9UGM5 382 aa19.7■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 HAUS5O94927 633 aa19.7■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 LSM8O95777 96 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 PCK1P35558 622 aa19.7■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 ARL2P36404 184 aa19.7■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa19.7■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 ZBTB33Q86T24 672 aa19.7■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 EMC1Q8N766 993 aa19.7■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 FAM71DQ8N9W8 422 aa19.7■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 NRG4Q8WWG1 115 aa19.7■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 SKA1Q96BD8 255 aa19.7■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 TEPSINQ96N21 525 aa19.7■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 TM9SF1O15321 606 aa19.69■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 FAM189A1O60320 539 aa19.69■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP19.69■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 KRT36O76013 467 aa19.69■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 ETV4P43268 484 aa19.69■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 NAMPTP43490 491 aa19.69■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 KLHL38Q2WGJ6 581 aa19.69■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 SLFN12LQ6IEE8 588 aa19.69■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 XRRA1Q6P2D8 792 aa19.69■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 RINLQ6ZS11 566 aa19.69■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 TSSK1BQ9BXA7 367 aa19.69■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa19.69■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 YIPF3Q9GZM5 350 aa19.69■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 VPS11Q9H270 941 aa19.69■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 NMRK1Q9NWW6 199 aa19.69■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 E5RJQ4 531 aa19.69■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 EGFRP00533 1210 aa19.69■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 BGNP21810 368 aa19.69■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 NEK3P51956 506 aa19.69■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 FSTL1Q12841 308 aa19.69■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 ACSBG2Q5FVE4 666 aa19.69■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 BBS12Q6ZW61 710 aa19.69■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 PCGF5Q86SE9 256 aa19.69■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 PALM2Q8IXS6 379 aa19.69■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 FAM111AQ96PZ2 611 aa19.69■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 RLFQ13129 1914 aa19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 GSC2O15499 205 aa19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 LPXNO60711 386 aa19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 DHRS4L1P0CG22 281 aa19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 KDELR1P24390 212 aa19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 ELK3P41970 407 aa19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 BASP1P80723 227 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 CAPSQ13938 189 aa19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 SH2D5Q6ZV89 423 aa19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 REPS2Q8NFH8 660 aa19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 RSAD2Q8WXG1 361 aa19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 DNAJC9Q8WXX5 260 aa19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 BTBD10Q9BSF8 475 aa19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 TRIM55Q9BYV6 548 aa19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 PCSK1NQ9UHG2 260 aa19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 SPDYE5A6NIY4 337 aa19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 SIGLEC16A6NMB1 481 aa19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 MAFGO15525 162 aa19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 ATG7O95352 703 aa19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 LDHAP00338 332 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 OATP04181 439 aa19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 DLDP09622 509 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 ARFIP2P53365 341 aa19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 FAAP100Q0VG06 881 aa19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 POLNQ7Z5Q5 900 aa19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 BRSK2Q8IWQ3 736 aa19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 SH3TC2Q8TF17 1288 aa19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 WDR60Q8WVS4 1066 aa19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 TTC17Q96AE7 1141 aa19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 IMPG2Q9BZV3 1241 aa19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 DCLRE1BQ9H816 532 aa19.68■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa19.67■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 STAM2O75886 525 aa19.67■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 FAM155BO75949 473 aa19.67■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 PTK7Q13308 1070 aa19.67■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 ORC1Q13415 861 aa19.67■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 RCN1Q15293 331 aa19.67■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 TAZQ16635 292 aa19.67■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa19.67■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 CIAPIN1Q6FI81 312 aa19.67■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 TEX9Q8N6V9 391 aa19.67■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 MTMR14Q8NCE2 650 aa19.67■□□□□ 0.74
CITED2-201ENST00000367651 FBXO41Q8TF61 875 aa19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms