RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 PPM1LQ5SGD2 360 aa18.52■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 FBXL6Q8N531 539 aa18.52■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 MNS1Q8NEH6 495 aa18.52■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 GPR88Q9GZN0 384 aa18.52■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 KIAA1586Q9HCI6 787 aa18.52■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 EPS15L1Q9UBC2 864 aa18.52■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 NENFQ9UMX5 172 aa18.52■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 COQ4Q9Y3A0 265 aa18.52■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 MYO15AQ9UKN7 3530 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 TSC2P49815 1807 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 ANO9A1A5B4 782 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 EFCAB8A8MWE9 144 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 GFPT2O94808 682 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 CYP3A5P20815 502 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 HOXA9P31269 272 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 GTF2H1P32780 548 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 KYAT1Q16773 422 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 C10orf76Q5T2E6 689 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF461Q8TAF7 563 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 FAM212AQ96EL1 285 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 M0QZQ0 153 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 NARSO43776 548 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 EXTL3O43909 919 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 SEC24AO95486 1093 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 LAMP2P13473 410 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 WNT7BP56706 349 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 TDGQ13569 410 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 USP37Q86T82 979 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 TRIM58Q8NG06 486 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 FAM122AQ96E09 287 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM8AQ9HCN3 771 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 PCDHB8Q9UN66 801 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 DMDP11532 3685 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 USP34Q70CQ2 3546 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 MACROD2A1Z1Q3 448 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 SPTLC1O15269 473 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 ARPP19P56211 112 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 POTEHQ6S545 545 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 OLIG1Q8TAK6 271 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 ITFG1Q8TB96 612 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 POLIQ9UNA4 740 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 V9GYY5 206 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 VPS13AQ96RL7 3174 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 TACC1O75410 805 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 FSHRP23945 695 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 ELF2Q15723 593 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 CTXN3Q4LDR2 81 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 KRT39Q6A163 491 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 SLFN12LQ6IEE8 588 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 SYT11Q9BT88 431 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF233A6NK53 670 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 BTNL10A8MVZ5 291 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 VNN2O95498 520 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 CCDC172P0C7W6 258 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 ATF2P15336 505 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 LILRA4P59901 499 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 CLDN10P78369 228 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 C9orf57Q5W0N0 161 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 SCARA3Q6AZY7 606 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 VPS36Q86VN1 386 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 ARHGEF19Q8IW93 802 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 EFCAB13Q8IY85 973 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 CEP112Q8N8E3 955 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 PRSS33Q8NF86 280 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 CCDC127Q96BQ5 260 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 IGSF9Q9P2J2 1179 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 SALL4Q9UJQ4 1053 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 NAGPAQ9UK23 515 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 DUSP12Q9UNI6 340 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 ARHGEF37A1IGU5 675 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 ANHXE9PGG2 379 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 H7C4K7 107 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 PIRO00625 290 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 OAZ2O95190 189 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 POU2F2P09086 479 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM132DQ14C87 1099 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms