RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025262.5

Ltb-201, Transcript of Lymphotoxin-beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ltb, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb-201ENSMUST00000025262 Crybg3Q80W49 1005 aa20.3■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Epb41l5Q8BGS1 731 aa20.3■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Itpk1Q8BYN3 419 aa20.3■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Znf276Q8CE64 614 aa20.3■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Smc2Q8CG48 1191 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cog3Q8CI04 820 aa20.3■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gripap1Q8VD04 806 aa20.3■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pdxdc1Q99K01 787 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cst12Q9DAN8 128 aa20.3■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm7903A2AWL1 463 aa20.29■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ugt1a10E9PXN7 530 aa20.29■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ugt1a6bK9J7B2 531 aa20.29■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ugt1a2P70691 533 aa20.29■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Togaram2Q3TYG6 1002 aa20.29■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zfp36l3Q5ISE2 725 aa20.29■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Prl2c1Q5SVL9 228 aa20.29■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ugt1a9Q62452 528 aa20.29■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ugt1a1Q63886 535 aa20.29■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ugt1a6Q64435 531 aa20.29■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cyp3a16Q64481 504 aa20.29■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gpsm1Q6IR34 673 aa20.29■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tmeff1Q6PFE7 372 aa20.29■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ugt1a7cQ6ZQM8 531 aa20.29■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Znf579Q80VM4 562 aa20.29■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zbtb46Q8BID6 600 aa20.29■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Usp37Q8C0R0 979 aa20.29■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rpap2Q8VC34 614 aa20.29■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pcdhgb1Q91XX8 918 aa20.29■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mms19Q9D071 1031 aa20.29■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gstt4Q9D4P7 240 aa20.29■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 PirQ9D711 290 aa20.29■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sgpp1Q9JI99 430 aa20.29■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ms4a14A0A087WSD2 1232 aa20.28■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr391-psA0A0U1RNJ4 312 aa20.28■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Vmn2r71L7N2D8 855 aa20.28■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Bnc1O35914 961 aa20.28■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cd8aP01731 247 aa20.28■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Osgin2Q3TEE9 550 aa20.28■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kdm7aQ3UWM4 940 aa20.28■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 DgkqQ6P5E8 934 aa20.28■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rxfp1Q6R6I7 758 aa20.28■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Apbb3Q8R1C9 486 aa20.28■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pcdha2Q91Y17 948 aa20.28■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Prmt2Q9R144 448 aa20.28■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zfhx4Q9JJN2 3550 aa20.28■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 TrdnE9Q9K5 693 aa20.27■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Per3O70361 1113 aa20.27■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Krt18P05784 423 aa20.27■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nfkb1P25799 971 aa20.27■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gnl1P36916 607 aa20.27■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 PfplQ5RKV8 702 aa20.27■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mapre1Q61166 268 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Igfbp7Q61581 281 aa20.27■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gucy2gQ6TL19 1100 aa20.27■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Chn2Q80XD1 332 aa20.27■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Samd3Q8C4H2 520 aa20.27■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 CtbsQ8R242 366 aa20.27■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nol6Q8R5K4 1152 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mat1aQ91X83 396 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mrps2Q924T2 291 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Smc3Q9CW03 1217 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 PignQ9R1S3 931 aa20.27■□□□□ 0.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zfand4D3Z3C6 739 aa20.26■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Taf4bG5E8Z2 855 aa20.26■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cacna2d1O08532 1103 aa20.26■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gria2P23819 883 aa20.26■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 IduaP48441 634 aa20.26■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Arhgap39P59281 1107 aa20.26■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rnf224Q3UIW8 156 aa20.26■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rsad1Q5SUV1 442 aa20.26■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 RragbQ6NTA4 374 aa20.26■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 RbfaQ6P3B9 350 aa20.26■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Herc4Q6PAV2 1057 aa20.26■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Znf653Q6YND2 615 aa20.26■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fbxo38Q8BMI0 1194 aa20.26■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tmem74Q8BQU7 305 aa20.26■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pyhin1Q8BV49 420 aa20.26■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Csgalnact2Q8C1F4 542 aa20.26■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zdhhc6Q9CPV7 413 aa20.26■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Clic4Q9QYB1 253 aa20.26■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mettl1Q9Z120 268 aa20.26■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Map1bP14873 2464 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 A0A1L1STL9 112 aa20.25■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rhox3cA2AWM0 215 aa20.25■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rad51ap2G3UW63 976 aa20.25■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rhox3hL7MU37 215 aa20.25■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 EdaO54693 391 aa20.25■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Msh3P13705 1091 aa20.25■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 AdkP55264 361 aa20.25■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rhox3aQ4TU90 215 aa20.25■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ptpn21Q62136 1176 aa20.25■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tbc1d12Q6A039 696 aa20.25■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Taf15Q8BQ46 557 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ccdc122Q8BVN0 290 aa20.25■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cwf19l1Q8CI33 537 aa20.25■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Taf10Q8K0H5 218 aa20.25■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Prpf6Q91YR7 941 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lama1P19137 3084 aa20.24■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 PtprdQ64487 1912 aa20.24■□□□□ 0.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 BC034090A0A087WP46 1202 aa20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.6 ms