RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J DXO1Q06349 442 aa1.83□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J DGA1Q08650 418 aa1.83□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J TIM22Q12328 207 aa1.83□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J YBR200W-AQ3E755 54 aa1.83□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J YBR298C-AQ8TGK4 73 aa1.83□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J RTC6O14464 93 aa1.82□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP1.82□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J PAU1P0CE88 120 aa1.82□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J PAU14P0CE89 120 aa1.82□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J PAU6P0CE90 120 aa1.82□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J PAU18P0CE91 120 aa1.82□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J PAU8P0CE92 120 aa1.82□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J PAU11P0CE93 120 aa1.82□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J POF1P25576 258 aa1.82□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J MSK1P32048 576 aa1.82□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J ACP1P32463 125 aa1.82□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J PAU13P38725 120 aa1.82□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J SUR2P38992 349 aa1.82□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J PGD1P40356 397 aa1.82□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J YFL067WP43537 175 aa1.82□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J YFR045WP43617 309 aa1.82□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J DAD3P69850 94 aa1.82□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J PAU10Q03050 120 aa1.82□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J AIM34Q03673 198 aa1.82□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J NAT3Q06504 195 aa1.82□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR042CQ07990 161 aa1.82□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J PAU20Q08322 120 aa1.82□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data1.82□□□□□ -2.12not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J PAU9Q3E770 120 aa1.82□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR342W-AQ3E810 57 aa1.82□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J YLL066W-BQ8TGJ7 56 aa1.82□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J MRP10O75012 95 aa1.81□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR034C-AP0C289 58 aa1.81□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J SPC25P40014 221 aa1.81□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J YCH1P42937 148 aa1.81□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J BRP1P53194 125 aa1.81□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR105WQ08504 108 aa1.81□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J CSM4Q08955 156 aa1.81□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J TY1A-NL2Q12470 440 aa1.81□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J COX19Q3E731 98 aa1.81□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J PCC1Q3E833 88 aa1.81□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J YCL001W-BQ96VH2 84 aa1.81□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J YAR023CD6VPM8 179 aa1.8□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL33AP05744 107 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J YCR023CP25351 611 aa1.8□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J YHR140WP38842 239 aa1.8□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J TEM1P38987 245 aa1.8□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J CYB5P40312 120 aa1.8□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL33BP41056 107 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J SNN1P48232 102 aa1.8□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J YGL088WP53151 121 aa1.8□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J PMP3P87284 55 aa1.8□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR320WQ04897 101 aa1.8□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J SMT3Q12306 101 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J SNU23Q12368 194 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J YBR085C-AO43137 85 aa1.79□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS22AP0C0W1 130 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL12BP0CX54 165 aa1.79□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP1.79□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J CUP2P15315 225 aa1.79□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J YBR209WP38311 105 aa1.79□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J SHG1P38337 142 aa1.79□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J RPB11P38902 120 aa1.79□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J YDL183CP48569 320 aa1.79□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J YGL185CP53100 379 aa1.79□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J THG1P53215 237 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J UPS3Q04006 179 aa1.79□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J TVP18Q04767 167 aa1.79□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J UTP23Q12339 254 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J TY1A-DR3Q12441 440 aa1.79□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J FMP49A0A023PZB3 126 aa1.78□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J FRS1P15624 595 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J YGL010WP25338 174 aa1.78□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J PAM17P36147 197 aa1.78□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J DAD2P36162 133 aa1.78□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J MIX23P38162 196 aa1.78□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J SDH8P38345 138 aa1.78□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data1.78□□□□□ -2.12not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J YIL059CP40520 121 aa1.78□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J COX16P47081 118 aa1.78□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J NUP42P49686 430 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR026WP53217 278 aa1.78□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J ATP19P81451 68 aa1.78□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR115WQ04598 105 aa1.78□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J DCN1Q12395 269 aa1.78□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J FMP16Q12497 93 aa1.78□□□□□ -2.12
tW(CCA)JtW(CCA)J TY1A-DR4O74302 440 aa1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J YJL197C-AP0C5P0 93 aa1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J TY1A-AP0CX57 440 aa1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J TY1A-PR1P0CX58 440 aa1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J TY1A-ORP0CX59 440 aa1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J TY1A-PR2P0CX60 440 aa1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J TY1A-DR5P0CX65 440 aa1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J TY1A-ER2P0CX66 440 aa1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J TY1A-GR3P0CX67 440 aa1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J TY1A-LR1P0CX68 440 aa1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J TY1A-MR2P0CX69 440 aa1.77□□□□□ -2.13
tW(CCA)JtW(CCA)J TIR1P10863 254 aa1.77□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 168.9 ms