RNA–Protein interactions for RNA: YPR119W

CLB2, Transcript of B-type cyclin involved in cell cycle progression, yeast

Gene CLB2, Length 1,476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cellular bud .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLB2	YPR119W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	HUA1	P40325	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	PCP1	P53259	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	HSK3	P69852	69 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	RAF1	Q06891	181 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	DGA1	Q08650	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	RFM1	Q12192	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	YOX1	P34161	385 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	CSH1	P38287	376 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	API2	Q04413	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
CLB2	YPR119W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	ERG8	P24521	451 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	UGX2	P32772	223 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	SDH7	Q04401	133 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	YMR103C	Q04436	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	JID1	Q12350	301 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	TOA2	P32774	122 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	EGT2	P42835	1041 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	RAD6	P06104	172 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	REE1	P40893	198 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	NCA3	P46955	337 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	DAD4	P69851	72 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	DAD1	Q12248	94 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	KRE1	P17260	313 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	MLF3	P32047	452 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	PET8	P38921	284 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	YIL086C	P40503	102 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	LST8	P41318	303 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	BNA2	P47125	453 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	MST27	P53176	234 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	MSA1	Q08471	629 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	MRPS5	P33759	307 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	PGU1	P47180	361 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	STF1	P01098	86 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	YBL071C	P38185	102 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	YJL118W	P47022	219 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	UBC7	Q02159	165 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	SDC1	Q03323	175 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	NUP53	Q03790	475 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	BLM10	P43583	2143 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	MSN1	P22148	382 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	GPI18	P38211	433 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	OXA1	P39952	402 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	CIS3	P47001	227 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	HST4	P53688	370 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	GPI19	Q04082	140 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	YPL261C	Q08976	102 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	YCR022C	P25620	114 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	YKR032W	P36127	104 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	YNL217W	P40152	326 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	YDL186W	P48568	277 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	YGR018C	P53211	109 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	SWS2	P53937	143 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	MGR2	Q02889	113 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	YPL229W	Q99395	206 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	BET2	P20133	325 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	YCR085W	P25650	117 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	PCL2	P25693	308 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	YGR039W	P53225	103 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLB2	YPR119W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	PHO85	P17157	305 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	YKL070W	P36087	169 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	MOH1	P38191	138 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	YER076C	P40049	302 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	YMR141C	P40211	102 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	YFR057W	P43625	151 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	MIX14	Q04341	121 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	IGO2	Q9P305	131 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	PFY1	P07274	126 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	HMRA2	P0CY13	119 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	TIR2	P33890	251 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	YHR140W	P38842	239 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	CWP2	P43497	92 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	ATP23	P53722	227 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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