RNA–Protein interactions for RNA: YMR088C

VBA1, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA1	YMR088C	MYO1	P08964	1928 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	FLO11	P08640	1367 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	RIM9	Q04734	239 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	HPA2	Q06592	156 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	YOL160W	Q08321	113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	ODC2	Q99297	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	ECM29	P38737	1868 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	RIM15	P43565	1770 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	Q0255	P03881	472 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	YHL042W	P38729	150 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	SWS2	P53937	143 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	YOR385W	Q08909	290 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	BET1	P22804	142 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	YGL034C	P53186	121 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	YNL046W	P53956	172 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	SPG4	Q04438	115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	YLR296W	Q05898	108 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	EMC6	Q12431	108 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	FKS3	Q04952	1785 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	OM14	P38325	134 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	YPS5	P53057	165 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	YGL088W	P53151	121 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	YOR292C	Q08743	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	CSR2	Q12734	1121 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	MIC10	Q96VH5	97 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	SWD3	P38123	315 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	SNF11	P38956	169 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	UBC13	P52490	153 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	YDR042C	Q03205	200 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	NPC2	Q12408	173 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	PIR5	P46999	287 aa		4.52	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	YNR064C	P53750	290 aa		4.52	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	YDL057W	Q07379	328 aa		4.52	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		4.52	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		4.52	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		4.52	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	GPX1	P36014	167 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	GGC1	P38988	300 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	RRT13	P40042	185 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	COX12	Q01519	83 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	RRT7	Q07829	113 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	YLR012C	Q07927	99 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	NDD1	Q08887	554 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	YOR015W	Q12169	119 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	NUP192	P47054	1683 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	MDH2	P22133	377 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	RPP1	P38786	293 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	KEG1	P43614	200 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	VPS25	P47142	202 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	HAL1	Q01766	294 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	ELP6	Q04868	273 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	SYM1	Q06563	197 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	YLR112W	Q12130	139 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	YPL247C	Q12523	523 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	YGL193C	P53097	103 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	MIX14	Q04341	121 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	YOR105W	Q08504	108 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	YDL211C	Q12121	372 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	RRT15	Q3E811	62 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.49	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	ERG4	P25340	473 aa		4.49	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	YCR006C	P25350	157 aa		4.49	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	YGR050C	P53231	118 aa		4.49	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	SUT2	Q12286	268 aa		4.49	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	RNQ1	P25367	405 aa		4.48	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	MRPL39	P36533	70 aa		4.48	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	CDC1	P40986	491 aa		4.48	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		4.48	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.48	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	YPT10	P38146	199 aa		4.48	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	TDA2	P40045	126 aa		4.48	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	YFR035C	P43608	114 aa		4.48	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.48	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	GSC2	P40989	1895 aa		4.47	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	FZF1	P32805	299 aa		4.47	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	TIM17	P39515	158 aa		4.47	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	YNL217W	P40152	326 aa		4.47	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	YIL169C	P40442	995 aa		4.47	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	DFG10	P40526	253 aa		4.47	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	TPC1	P53257	314 aa		4.47	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		4.47	□□□□□ -1.69
VBA1	YMR088C	APC1	P53886	1748 aa		4.47	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 56.2 ms