RNA–Protein interactions for RNA: YLR048W

RPS0B, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS0B, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS0B	YLR048W	GPI11	Q06636	219 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	FAB1	P34756	2278 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	SPP41	P38904	1435 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	SNT2	P53127	1403 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	ECM31	P38122	312 aa		2.8	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	YEL008W	P40001	126 aa		2.8	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		2.8	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	SRL3	P36167	246 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	HSP10	P38910	106 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	YAR029W	P39549	74 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	DCV1	P43595	202 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	FYV7	Q12247	151 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	FUN14	P18411	198 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	SEC59	P20048	519 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	YGL230C	P53074	147 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	YGL149W	P53116	101 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	ERV14	P53173	138 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	RTR2	Q12378	196 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RPS0B	YLR048W	YCR099C	P25657	155 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPS0B	YLR048W	YKL044W	P36092	106 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPS0B	YLR048W	PAM16	P42949	149 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPS0B	YLR048W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
RPS0B	YLR048W	BRP1	P53194	125 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPS0B	YLR048W	GTT2	Q12390	233 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RPS0B	YLR048W	PAU21	P0CE86	164 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPS0B	YLR048W	PAU22	P0CE87	164 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPS0B	YLR048W	YGL010W	P25338	174 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPS0B	YLR048W	SNF11	P38956	169 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPS0B	YLR048W	YPL067C	Q02754	198 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RPS0B	YLR048W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RPS0B	YLR048W	COA3	Q3E7B2	85 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RPS0B	YLR048W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RPS0B	YLR048W	YFL051C	P43552	160 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPS0B	YLR048W	YFR035C	P43608	114 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPS0B	YLR048W	MHF1	Q3E835	90 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RPS0B	YLR048W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RPS0B	YLR048W	UBR1	P19812	1950 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPS0B	YLR048W	HAP3	P13434	144 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPS0B	YLR048W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RPS0B	YLR048W	YCL042W	P25572	119 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPS0B	YLR048W	YBR242W	P38331	238 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPS0B	YLR048W	GPI19	Q04082	140 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RPS0B	YLR048W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RPS0B	YLR048W	YCR101C	P25607	182 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RPS0B	YLR048W	TDA2	P40045	126 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RPS0B	YLR048W	TSC11	P40061	1430 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RPS0B	YLR048W	VAR1	P02381	398 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RPS0B	YLR048W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
RPS0B	YLR048W	YFL065C	P43539	102 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RPS0B	YLR048W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
RPS0B	YLR048W	YBR027C	P38220	110 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RPS0B	YLR048W	OCA6	Q12454	224 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RPS0B	YLR048W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
RPS0B	YLR048W	YGR164W	P53291	111 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RPS0B	YLR048W	VAM10	Q08474	114 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RPS0B	YLR048W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
RPS0B	YLR048W	RTC6	O14464	93 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RPS0B	YLR048W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
RPS0B	YLR048W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	2.67	□□□□□ -1.98	not detected
RPS0B	YLR048W	SED1	Q01589	338 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RPS0B	YLR048W	FIT1	Q04433	528 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RPS0B	YLR048W	MED11	Q99278	115 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RPS0B	YLR048W	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
RPS0B	YLR048W	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
RPS0B	YLR048W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
RPS0B	YLR048W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
RPS0B	YLR048W	YBR090C	P38253	122 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RPS0B	YLR048W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
RPS0B	YLR048W	YGL014C-A	P0C5N1	53 aa		2.65	□□□□□ -1.99
RPS0B	YLR048W	YHR213W	P0CI67	198 aa		2.65	□□□□□ -1.99
RPS0B	YLR048W	MRPL15	P36523	253 aa		2.65	□□□□□ -1.99
RPS0B	YLR048W	AIM18	P38884	321 aa		2.65	□□□□□ -1.99
RPS0B	YLR048W	YLR296W	Q05898	108 aa		2.65	□□□□□ -1.99
RPS0B	YLR048W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		2.65	□□□□□ -1.99
RPS0B	YLR048W	TRM732	Q03496	1420 aa		2.65	□□□□□ -1.99
RPS0B	YLR048W	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
RPS0B	YLR048W	HAP2	P06774	265 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RPS0B	YLR048W	YHR130C	P38834	111 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RPS0B	YLR048W	YEA6	P39953	335 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RPS0B	YLR048W	LST8	P41318	303 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RPS0B	YLR048W	IGO1	P53897	168 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RPS0B	YLR048W	YMR103C	Q04436	120 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RPS0B	YLR048W	ZEO1	Q08245	113 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RPS0B	YLR048W	YPL261C	Q08976	102 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RPS0B	YLR048W	UBC5	P15732	148 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RPS0B	YLR048W	YPR203W	Q08994	102 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RPS0B	YLR048W	BUD4	P47136	1447 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RPS0B	YLR048W	PFY1	P07274	126 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RPS0B	YLR048W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
RPS0B	YLR048W	YER187W	P40102	141 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RPS0B	YLR048W	PAU12	P53343	120 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RPS0B	YLR048W	YMR122C	Q03879	124 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RPS0B	YLR048W	SEN15	Q04675	128 aa		2.62	□□□□□ -1.99

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