RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590843.1

SEH1L-208, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 5,206 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-208ENST00000590843 ENC1O14682 589 aa11.96□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 FOXN1O15353 648 aa11.96□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP11.96□□□□□ -0.59e-7■■□□□ 13
SEH1L-208ENST00000590843 NPTX2P47972 431 aa11.96□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 CASP7P55210 303 aa11.96□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 GPC5P78333 572 aa11.96□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 BASP1P80723 227 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 GIPC2Q8TF65 315 aa11.96□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 MTMR9Q96QG7 549 aa11.96□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 ADGRE3Q9BY15 652 aa11.96□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 BCAP29Q9UHQ4 241 aa11.96□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 TNFSF13BQ9Y275 285 aa11.96□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 MAFO75444 373 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 OR1D2P34982 312 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 MYBPC2Q14324 1141 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 COLEC12Q5KU26 742 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 RBPJLQ9UBG7 517 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 RCOR1Q9UKL0 485 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 KPNA7A9QM74 516 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 MCUQ8NE86 351 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 SLC5A5Q92911 643 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 HYOU1Q9Y4L1 999 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 PPFIA2O75334 1257 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 AMD1P17707 334 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 TCP1P17987 556 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 AKAP5P24588 427 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 GAD2Q05329 585 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 GRM3Q14832 879 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 MFSD4BQ5TF39 518 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 FBXW10Q5XX13 1052 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 LZTR1Q8N653 840 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 ATP11CQ8NB49 1132 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 RNPEPQ9H4A4 650 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 SFXN1Q9H9B4 322 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 CEP72Q9P209 647 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 KRIT1O00522 736 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 DYNC1I1O14576 645 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 NVLO15381 856 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 CNPP09543 421 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 RGS7P49802 495 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 TROAPQ12815 778 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 PDIK1LQ8N165 341 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 OR6P1Q8NGX9 317 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 CYFIP2Q96F07 1278 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 EPSTI1Q96J88 318 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 SELENOSQ9BQE4 189 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 HAUS4Q9H6D7 363 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 SMPD4Q9NXE4 827 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 DERAQ9Y315 318 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 STARD13Q9Y3M8 1113 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 IFT172Q9UG01 1749 aa11.95□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 STX7O15400 261 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 DARSP14868 501 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 NDUFA8P51970 172 aa11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 ZBED6P86452 979 aa11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 SETDB1Q15047 1291 aa11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 TMC2Q8TDI7 906 aa11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 BHMTQ93088 406 aa11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 SELENONQ9NZV5 590 aa11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 DNAI1Q9UI46 699 aa11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 ANAPC7Q9UJX3 599 aa11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 SQORQ9Y6N5 450 aa11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 KCNK3O14649 394 aa11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 TIMP1P01033 207 aa11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 MFSD5Q6N075 450 aa11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 STOX1Q6ZVD7 989 aa11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 PASD1Q8IV76 773 aa11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 TRIM42Q8IWZ5 723 aa11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 ERVW-1Q9UQF0 538 aa11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 C2orf81A6NN90 581 aa11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 PDZK1P1A8MUH7 402 aa11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 PER2O15055 1255 aa11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 PYGLP06737 847 aa11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 MAPK9P45984 424 aa11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 RESTQ13127 1097 aa11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 PDGFRLQ15198 375 aa11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 ANKRD40Q6AI12 368 aa11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 FOXR1Q6PIV2 292 aa11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 PRR23CQ6ZRP0 262 aa11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 CALML6Q8TD86 181 aa11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 SCLYQ96I15 445 aa11.94□□□□□ -0.5
SEH1L-208ENST00000590843 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms