RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RGS2P41220 211 aa25.41■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IFNAR2P48551 515 aa25.41■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LONRF1Q17RB8 773 aa25.41■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SGO2Q562F6 1265 aa25.41■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CENPFP49454 3210 aa25.41■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GSTA1P08263 222 aa25.4■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CHKAP35790 457 aa25.4■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIF12Q96FN5 646 aa25.4■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HERPUD2Q9BSE4 406 aa25.4■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CHST7Q9NS84 486 aa25.4■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SAMD15Q9P1V8 674 aa25.4■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HMGXB4Q9UGU5 601 aa25.4■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 USTQ9Y2C2 406 aa25.4■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MGRN1O60291 552 aa25.4■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 VIMP08670 466 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WDTC1Q8N5D0 677 aa25.4■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HPDLQ96IR7 371 aa25.4■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DPP3Q9NY33 737 aa25.4■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PCDHGC3Q9UN70 934 aa25.4■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CEP83Q9Y592 693 aa25.4■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CITO14578 2027 aa25.4■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 O00370 1275 aa25.39■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OAS1P00973 400 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CALB1P05937 261 aa25.39■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GRM5P41594 1212 aa25.39■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PSEN2P49810 448 aa25.39■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SNX1Q13596 522 aa25.39■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DENND1BQ6P3S1 775 aa25.39■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FEZF2Q8TBJ5 459 aa25.39■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAGEC3Q8TD91 643 aa25.39■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DNAJB3Q8WWF6 145 aa25.39■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SERPINB12Q96P63 405 aa25.39■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TWNKQ96RR1 684 aa25.39■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLVAPQ9BX97 442 aa25.39■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AP5M1Q9H0R1 490 aa25.39■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa25.39■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ACSL3O95573 720 aa25.39■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ITIH2P19823 946 aa25.39■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATICP31939 592 aa25.39■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SSR1P43307 286 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CPT1AP50416 773 aa25.39■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RAD23BP54727 409 aa25.39■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IRF5Q13568 498 aa25.39■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa25.39■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WLSQ5T9L3 541 aa25.39■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC50Q8IVM0 306 aa25.39■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 APBA2Q99767 749 aa25.39■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CXCL16Q9H2A7 254 aa25.39■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SNTG2Q9NY99 539 aa25.39■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C2CD2Q9Y426 696 aa25.39■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC10A3P09131 477 aa25.38■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CREB1P16220 341 aa25.38■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GJC1P36383 396 aa25.38■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PTK6Q13882 451 aa25.38■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CYP4A22Q5TCH4 519 aa25.38■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 VSTM1Q6UX27 236 aa25.38■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa25.38■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ERICH1Q86X53 443 aa25.38■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATG4AQ8WYN0 398 aa25.38■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa25.38■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GJD2Q9UKL4 321 aa25.38■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ITGA11Q9UKX5 1188 aa25.38■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HES2Q9Y543 173 aa25.38■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SNX3O60493 162 aa25.37■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TAS2R40P59535 323 aa25.37■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DNAJC24Q6P3W2 148 aa25.37■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC27A1Q6PCB7 646 aa25.37■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MCEEQ96PE7 176 aa25.37■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa25.37■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HOMER3Q9NSC5 361 aa25.37■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ASIC3Q9UHC3 531 aa25.37■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TREHO43280 583 aa25.37■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CRHR2Q13324 411 aa25.37■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC4A11Q8NBS3 891 aa25.37■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SNF8Q96H20 258 aa25.37■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ELOVL4Q9GZR5 314 aa25.37■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MED7O43513 233 aa25.36■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 P4HA1P13674 534 aa25.36■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DARSP14868 501 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RBP5P82980 135 aa25.36■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CDC42EP1Q00587 391 aa25.36■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SOCS4Q8WXH5 440 aa25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms