RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 MPP4Q96JB8 637 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 FMO2Q99518 471 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 WNT8AQ9H1J5 351 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC68Q9H2F9 335 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF148Q9UQR1 794 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM247A6NEH6 219 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ATG7O95352 703 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ADCY8P40145 1251 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 MXRA7P84157 204 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 COL19A1Q14993 1142 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM132DQ14C87 1099 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CLUL1Q15846 466 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 GRIK4Q16099 956 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CDO1Q16878 200 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CYP4A22Q5TCH4 519 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 RSPH3Q86UC2 560 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 WDR49Q8IV35 697 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 SMC1BQ8NDV3 1235 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 OR6B3Q8NGW1 331 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 NMRK2Q9NPI5 230 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 HESX1Q9UBX0 185 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 GGA2Q9UJY4 613 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 COG5Q9UP83 839 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 SNX9Q9Y5X1 595 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 SCINQ9Y6U3 715 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ABLIM1O14639 778 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 NPTXRO95502 500 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 KRT14P02533 472 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 EDNRBP24530 442 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 TRADDQ15628 312 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM72Q6ZMU5 477 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ALG3Q92685 438 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 FBXL18Q96ME1 805 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 MCEEQ96PE7 176 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ZSWIM1Q9BR11 485 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CDT1Q9H211 546 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 KLK14Q9P0G3 267 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CIDEBQ9UHD4 219 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 PCSK1NQ9UHG2 260 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 HES2Q9Y543 173 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 COMMD10Q9Y6G5 202 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 M0QYV0 167 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 NDUFAB1O14561 156 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 MED7O43513 233 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 NDUFB5O43674 189 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 MSCO60682 206 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CNMDO75829 334 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 STBD1O95210 358 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 KRT1P04264 644 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CTSHP09668 335 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 MYZAPP0CAP1 466 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 PTENP60484 403 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 BEX3Q00994 111 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 INAQ16352 499 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 GNASQ5JWF2 1037 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 OR6B2Q6IFH4 312 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC57Q8N9N7 239 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 SHCBP1Q8NEM2 672 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ACTRT1Q8TDG2 376 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 HPDLQ96IR7 371 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CALN1Q9BXU9 219 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 MINDY3Q9H8M7 445 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 HPCAL4Q9UM19 191 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 POLIQ9UNA4 740 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 C2CD2Q9Y426 696 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 PTPRJQ12913 1337 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 PASKQ96RG2 1323 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 SSC5DA1L4H1 1573 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 MYCP01106 439 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 HSPA6P17066 643 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ENPP1P22413 925 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 PSMA2P25787 234 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 WNT7BP56706 349 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CUL1Q13616 776 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 AMHR2Q16671 573 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 SH2D4BQ5SQS7 431 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 LDLRAD1Q5T700 205 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 SPRYD7Q5W111 196 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 MCOLN2Q8IZK6 566 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 C18orf8Q96DM3 657 aa8.24□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms