RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489824.1

RPS6KB1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase B1, humanhuman

TSL 3

Gene RPS6KB1, Length 909 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1-208ENST00000489824 WDR44Q5JSH3 913 aa20.88■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 SCN4BQ8IWT1 228 aa20.88■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 FAM83CQ9BQN1 747 aa20.88■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 TNMDQ9H2S6 317 aa20.88■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 TCHHQ07283 1943 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 HRO43593 1189 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 LRP3O75074 770 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 ATG13O75143 517 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 NOL4O94818 638 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 PDGFRLQ15198 375 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 DUOXA2Q1HG44 320 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 TRIM68Q6AZZ1 485 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 C4orf50Q6ZRC1 276 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 FSIP1Q8NA03 581 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 HPDLQ96IR7 371 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 FAM84AQ96KN4 292 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 CUEDC2Q9H467 287 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 KIAA1586Q9HCI6 787 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 PARD6AQ9NPB6 346 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 INTS13Q9NVM9 706 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 SIX4Q9UIU6 781 aa20.87■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 CKMP06732 381 aa20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 CFAP221Q4G0U5 840 aa20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 DPH6Q7L8W6 267 aa20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 OSTM1Q86WC4 334 aa20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 CPA6Q8N4T0 437 aa20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 CXorf38Q8TB03 319 aa20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 RTKNQ9BST9 563 aa20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 HPS4Q9NQG7 708 aa20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 SLC8A2Q9UPR5 921 aa20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 GABRDO14764 452 aa20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 SPTLC2O15270 562 aa20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 USP17L7P0C7H9 530 aa20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 ARSAP15289 507 aa20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 TGM1P22735 817 aa20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 HOXA6P31267 233 aa20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 ASIC1P78348 528 aa20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 FAM160A1Q05DH4 1040 aa20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 MTF1Q14872 753 aa20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 SOWAHAQ2M3V2 549 aa20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 TMEM196Q5HYL7 178 aa20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 WDR5BQ86VZ2 330 aa20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 CBWD2Q8IUF1 395 aa20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 DHX58Q96C10 678 aa20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 MYRFLQ96LU7 910 aa20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 MMS19Q96T76 1030 aa20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 PKMYT1Q99640 499 aa20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 SYT15Q9BQS2 421 aa20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 C2orf42Q9NWW7 574 aa20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 CDH9Q9ULB4 789 aa20.85■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 IFNAR2P48551 515 aa20.84■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 KCNB1Q14721 858 aa20.84■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 WDR49Q8IV35 697 aa20.84■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 IQUBQ8NA54 791 aa20.84■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 OR5B17Q8NGF7 314 aa20.84■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 HPS3Q969F9 1004 aa20.84■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 SEMA4GQ9NTN9 838 aa20.84■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP20.83■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 HCRTO43612 131 aa20.83■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 PPP6R2O75170 966 aa20.83■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 TADA3O75528 432 aa20.83■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 DRD1P21728 446 aa20.83■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 ANXA13P27216 316 aa20.83■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 MAGEA11P43364 429 aa20.83■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 PDE6CP51160 858 aa20.83■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 CYP27A1Q02318 531 aa20.83■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 CSRP2Q16527 193 aa20.83■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 CCDC142Q17RM4 750 aa20.83■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 SCARA3Q6AZY7 606 aa20.83■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 FSTL4Q6MZW2 842 aa20.83■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.83■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 NETO1Q8TDF5 533 aa20.83■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 ATP2A3Q93084 1043 aa20.83■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 FNBP1Q96RU3 617 aa20.83■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 P2RY13Q9BPV8 354 aa20.83■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 TRIM9Q9C026 710 aa20.83■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 KBTBD4Q9NVX7 518 aa20.83■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
RPS6KB1-208ENST00000489824 PTPRJQ12913 1337 aa20.82■□□□□ 0.92
RPS6KB1-208ENST00000489824 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
RPS6KB1-208ENST00000489824 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms