RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252771.11

FCHO1-201, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,118 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-201ENST00000252771 ITIH2P19823 946 aa17.94■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 VPS41P49754 854 aa17.94■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 ITGA8P53708 1063 aa17.94■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 CDC42EP1Q00587 391 aa17.94■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 KCNT1Q5JUK3 1230 aa17.94■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP17.94■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 TSPAN16Q9UKR8 245 aa17.94■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 PIK3R2O00459 728 aa17.94■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 RIPK2O43353 540 aa17.94■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 LIASO43766 372 aa17.94■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 GAS8O95995 478 aa17.94■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 KLRC2P26717 231 aa17.94■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 HPDP32754 393 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 PSMC4P43686 418 aa17.94■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 SNX17Q15036 470 aa17.94■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 FAM129AQ9BZQ8 928 aa17.94■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 SYNCQ9H7C4 482 aa17.94■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 DERAQ9Y315 318 aa17.94■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 SNX9Q9Y5X1 595 aa17.94■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP17.93■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 CAND2O75155 1236 aa17.93■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 MYL3P08590 195 aa17.93■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 CTGFP29279 349 aa17.93■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 PPARDQ03181 441 aa17.93■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 SKIDA1Q1XH10 827 aa17.93■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 TFDP3Q5H9I0 405 aa17.93■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 DENND2CQ68D51 928 aa17.93■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 TRNP1Q6NT89 227 aa17.93■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 LCLAT1Q6UWP7 414 aa17.93■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 PWWP2AQ96N64 755 aa17.93■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 NT5C1AQ9BXI3 368 aa17.93■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 WDR35Q9P2L0 1181 aa17.93■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 LRRD1A4D1F6 860 aa17.93■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 RECQL4O94761 1208 aa17.93■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 PTPN7P35236 360 aa17.93■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 IFFO1Q0D2I5 559 aa17.93■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 MYO1EQ12965 1108 aa17.93■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 AGBL2Q5U5Z8 902 aa17.93■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 POLNQ7Z5Q5 900 aa17.93■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 CCDC25Q86WR0 208 aa17.93■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 RNF39Q9H2S5 420 aa17.93■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 ZWILCHQ9H900 591 aa17.93■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 CNTN3Q9P232 1028 aa17.93■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 TULP2O00295 520 aa17.92■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 TJP3O95049 919 aa17.92■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 ADCY8P40145 1251 aa17.92■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 COPS2P61201 443 aa17.92■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 SLMAPQ14BN4 828 aa17.92■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 IFNL1Q8IU54 200 aa17.92■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 RABEP2Q9H5N1 569 aa17.92■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 CPT1AP50416 773 aa17.92■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 TAF5Q15542 800 aa17.92■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 RAB6CQ53S08 254 aa17.92■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 SAPCD2Q86UD0 394 aa17.92■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 LPIN3Q9BQK8 851 aa17.92■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 APOL6Q9BWW8 343 aa17.92■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 RAB6CQ9H0N0 254 aa17.92■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 HCRTO43612 131 aa17.92■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 CD48P09326 243 aa17.92■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 UBXN11Q5T124 520 aa17.92■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa17.92■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 ACOT1Q86TX2 421 aa17.92■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 HAUS1Q96CS2 278 aa17.92■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa17.92■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 E5RJQ4 531 aa17.91■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 ATF2P15336 505 aa17.91■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 YARSP54577 528 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP17.91■□□□□ 0.462e-6■■□□□ 11.8
FCHO1-201ENST00000252771 PKDCCQ504Y2 493 aa17.91■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 C9orf57Q5W0N0 161 aa17.91■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 TLCD1Q96CP7 247 aa17.91■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 KLK14Q9P0G3 267 aa17.91■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 HTTP42858 3142 aa17.91■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 CETN2P41208 172 aa17.91■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 SOWAHAQ2M3V2 549 aa17.91■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 TTC30AQ86WT1 665 aa17.91■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 TRAIPQ9BWF2 469 aa17.91■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 MYADML2A6NDP7 307 aa17.9■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa17.9■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 ETS1P14921 441 aa17.9■□□□□ 0.46
FCHO1-201ENST00000252771 HOXC8P31273 242 aa17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms