RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lancl3Q8CD19 420 aa24.15■■□□□ 1.46
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rassf9Q8K342 435 aa24.15■■□□□ 1.46
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mrps2Q924T2 291 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mlf2Q99KX1 247 aa24.15■■□□□ 1.46
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dkc1Q9ESX5 509 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PrebQ9WUQ2 417 aa24.15■■□□□ 1.46
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ttc9Q3V038 219 aa24.14■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfp791Q497V9 528 aa24.14■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Smarcd1Q61466 515 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Aldh1a2Q62148 518 aa24.14■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Defb34Q7TNV8 81 aa24.14■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ankrd24Q80VM7 985 aa24.14■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zbtb49Q8BXX2 756 aa24.14■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tgif2Q8C0Y1 237 aa24.14■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Samd3Q8C4H2 520 aa24.14■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gtpbp10Q8K013 366 aa24.14■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lrrc14Q8VC16 493 aa24.14■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fads1Q920L1 447 aa24.14■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ubox5Q925F4 539 aa24.14■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arhgef10Q8C033 1345 aa24.13■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Unc13dB2RUP2 1085 aa24.13■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hsd17b14E9Q3D4 273 aa24.13■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Stx1aO35526 288 aa24.13■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyp8b1O88962 500 aa24.13■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ctnnd1P30999 938 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc61Q3UJV1 511 aa24.13■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Snx19Q6P4T1 997 aa24.13■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sema4fQ9Z123 777 aa24.13■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rtl9Q32KG4 1339 aa24.12■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm6657A0A1B0GRJ3 277 aa24.12■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 SpaarA0A1B0GSZ0 75 aa24.12■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm10718D3Z1I7 227 aa24.12■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pcsk6F6XJP7 959 aa24.12■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Angpt1O08538 498 aa24.12■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 SrgnP13609 152 aa24.12■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trim72Q1XH17 477 aa24.12■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trim17Q7TPM3 477 aa24.12■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Enox1Q8BHR2 643 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arl14epQ8BIX3 276 aa24.12■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Elmo3Q8BYZ7 720 aa24.12■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 NemfQ8CCP0 1064 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Snx9Q91VH2 595 aa24.12■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znf622Q91VY9 476 aa24.12■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pde6cQ91ZQ1 861 aa24.12■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ube2sQ921J4 223 aa24.12■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Smarcd2Q99JR8 531 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tlr3Q99MB1 905 aa24.12■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Filip1Q9CS72 1211 aa24.12■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 TarsQ9D0R2 722 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dctpp1Q9QY93 170 aa24.12■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 NumbQ9QZS3 653 aa24.12■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kcnd2Q9Z0V2 630 aa24.12■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfp236S4R299 1847 aa24.12■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lrrc73B2RWC4 316 aa24.11■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ybx1P62960 322 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wbp2P97765 261 aa24.11■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nlrc4Q3UP24 1024 aa24.11■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyfip2Q5SQX6 1253 aa24.11■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dnajc1Q61712 552 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zcchc2Q69ZB8 1166 aa24.11■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hdac10Q6P3E7 666 aa24.11■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vtcn1Q7TSP5 283 aa24.11■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Depdc1bQ8BH88 529 aa24.11■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 B130006D01RikQ8BRH6 153 aa24.11■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lmo3Q8BZL8 145 aa24.11■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ndufs2Q91WD5 463 aa24.11■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 DeraQ91YP3 318 aa24.11■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CrebzfQ91ZR3 358 aa24.11■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam49bQ921M7 324 aa24.11■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Q922M7 232 aa24.11■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Insl5Q9WUG6 135 aa24.11■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rev3lQ61493 3122 aa24.11■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 2210011C24RikA0A087WQ89 206 aa24.1■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rhox3cA2AWM0 215 aa24.1■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm8334F7CD45 553 aa24.1■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rhox3hL7MU37 215 aa24.1■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ImpactO55091 318 aa24.1■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fgd3O88842 733 aa24.1■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Krt13P08730 437 aa24.1■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lrrc4bP0C192 709 aa24.1■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ddx6P54823 483 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Adamts1P97857 968 aa24.1■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ptgs2Q05769 604 aa24.1■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sh3bp2Q06649 559 aa24.1■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rhox3aQ4TU90 215 aa24.1■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PrcpQ7TMR0 491 aa24.1■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Syt15Q8C6N3 418 aa24.1■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cacnb2Q8CC27 655 aa24.1■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ttc1Q91Z38 292 aa24.1■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mfap3Q922T2 349 aa24.1■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Npffr2Q924H0 417 aa24.1■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kif12Q9D2Z8 642 aa24.1■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Grtp1Q9D3N8 359 aa24.1■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cfap45Q9D9U9 551 aa24.1■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cacna2d1O08532 1103 aa24.09■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cd160O88875 185 aa24.09■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GpiP06745 558 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kif4P33174 1231 aa24.09■■□□□ 1.45
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Irf7P70434 457 aa24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.9 ms