Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
Sema4fQ9Z123 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Sema4fQ9Z123 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Sema4fQ9Z123 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Sema4fQ9Z123 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Sema4fQ9Z123 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Sema4fQ9Z123 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Sema4fQ9Z123 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Sema4fQ9Z123 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Sema4fQ9Z123 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Sema4fQ9Z123 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Sema4fQ9Z123 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Sema4fQ9Z123 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Sema4fQ9Z123 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Sema4fQ9Z123 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Sema4fQ9Z123 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Sema4fQ9Z123 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Sema4fQ9Z123 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Sema4fQ9Z123 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Sema4fQ9Z123 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sema4fQ9Z123 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Sema4fQ9Z123 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Sema4fQ9Z123 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Sema4fQ9Z123 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Sema4fQ9Z123 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Sema4fQ9Z123 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Sema4fQ9Z123 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Sema4fQ9Z123 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Sema4fQ9Z123 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Sema4fQ9Z123 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Sema4fQ9Z123 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Sema4fQ9Z123 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sema4fQ9Z123 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Sema4fQ9Z123 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Sema4fQ9Z123 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Sema4fQ9Z123 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sema4fQ9Z123 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sema4fQ9Z123 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Sema4fQ9Z123 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Sema4fQ9Z123 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Sema4fQ9Z123 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Sema4fQ9Z123 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Sema4fQ9Z123 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Sema4fQ9Z123 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Sema4fQ9Z123 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Sema4fQ9Z123 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sema4fQ9Z123 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Sema4fQ9Z123 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sema4fQ9Z123 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sema4fQ9Z123 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sema4fQ9Z123 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Sema4fQ9Z123 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sema4fQ9Z123 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sema4fQ9Z123 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Sema4fQ9Z123 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sema4fQ9Z123 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Sema4fQ9Z123 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Sema4fQ9Z123 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Sema4fQ9Z123 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sema4fQ9Z123 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sema4fQ9Z123 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sema4fQ9Z123 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sema4fQ9Z123 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Sema4fQ9Z123 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sema4fQ9Z123 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sema4fQ9Z123 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sema4fQ9Z123 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sema4fQ9Z123 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sema4fQ9Z123 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sema4fQ9Z123 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sema4fQ9Z123 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sema4fQ9Z123 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sema4fQ9Z123 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Sema4fQ9Z123 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sema4fQ9Z123 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sema4fQ9Z123 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sema4fQ9Z123 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sema4fQ9Z123 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sema4fQ9Z123 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sema4fQ9Z123 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sema4fQ9Z123 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sema4fQ9Z123 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sema4fQ9Z123 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sema4fQ9Z123 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sema4fQ9Z123 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sema4fQ9Z123 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sema4fQ9Z123 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sema4fQ9Z123 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sema4fQ9Z123 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sema4fQ9Z123 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sema4fQ9Z123 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sema4fQ9Z123 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sema4fQ9Z123 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sema4fQ9Z123 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sema4fQ9Z123 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Sema4fQ9Z123 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sema4fQ9Z123 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sema4fQ9Z123 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sema4fQ9Z123 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Sema4fQ9Z123 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms