RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ppp1r15bQ8BFW3 697 aa11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cep128Q8BI22 1102 aa11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HyiQ8R1F5 277 aa11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccar2Q8VDP4 922 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr385Q8VGT1 312 aa11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AjubaQ91XC0 547 aa11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Elmod3Q91YP6 381 aa11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ubox5Q925F4 539 aa11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PirQ9D711 290 aa11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dpysl5Q9EQF6 564 aa11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dnajb9Q9QYI6 222 aa11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 FrylF8VQ05 3007 aa11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cyp2j7A0A140T8U1 504 aa11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam129cD3YZB0 591 aa11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 LipiF6YQT7 476 aa11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dll3O88516 592 aa11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lmo2P25801 158 aa11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stat4P42228 749 aa11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TxkP42682 527 aa11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Uchl4P58321 233 aa11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ctc1Q5SUQ9 1212 aa11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Igfbp7Q61581 281 aa11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cyp3a16Q64481 504 aa11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 N4bp1Q6A037 893 aa11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klhl23Q6GQU2 558 aa11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HhipQ7TN16 700 aa11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Crybg3Q80W49 1005 aa11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Depdc1bQ8BH88 529 aa11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpatch3Q8BIY1 525 aa11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp202Q8C879 641 aa11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gga1Q8R0H9 635 aa11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Timd2Q8R183 305 aa11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Taf12Q8VE65 161 aa11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CoasyQ9DBL7 563 aa11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ndufa8Q9DCJ5 172 aa11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tlr5Q9JLF7 859 aa11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Igbp1bQ9QZ29 343 aa11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prpf40aQ9R1C7 953 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zbtb22Q9Z0G7 638 aa11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Smarcb1Q9Z0H3 385 aa11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfhx4Q9JJN2 3550 aa11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lama1P19137 3084 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sptbn4E9PX29 2561 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pde4dipQ80YT7 2224 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm3854A0A1B0GSS6 495 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Col9a3A2ACT7 680 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wdr72D3YYM4 1114 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfand4D3Z3C6 739 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gimap9G3X987 291 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Odc1P00860 461 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gjb3P28231 270 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gnl1P36916 607 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mcm4P49717 862 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Csrp2P97314 193 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CtscP97821 462 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc61Q3UJV1 511 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Eri2Q5BKS4 688 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ksr1Q61097 873 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 March6Q6ZQ89 909 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tbx10Q810F8 385 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lig4Q8BTF7 911 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Itpk1Q8BYN3 419 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q8CDN1 933 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sirt3Q8R104 334 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Eps8l1Q8R5F8 716 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf622Q91VY9 476 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tor1aip1Q921T2 595 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tom1l1Q923U0 474 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tlr3Q99MB1 905 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Brms1Q99N20 246 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tex46Q9CPU3 165 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q9CQM1 111 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gstt4Q9D4P7 240 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q9D9D9 101 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Erap1Q9EQH2 930 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Jph3Q9ET77 744 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tacc2Q9JJG0 1149 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PrebQ9WUQ2 417 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trpc7Q9WVC5 862 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PtprdQ64487 1912 aa11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Eml5Q8BQM8 1977 aa11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ddx23D3Z0M9 819 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tpm3-rs7D3Z2H9 248 aa11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm2897K7N6T7 172 aa11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gja4P28235 333 aa11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Usp46P62069 366 aa11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Psmc1P62192 440 aa11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cuzd1P70412 606 aa11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rab33aP97950 237 aa11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kcnb1Q03717 857 aa11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 IdsQ08890 552 aa11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arhgap10Q6Y5D8 786 aa11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Defb34Q7TNV8 81 aa11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pcsk9Q80W65 694 aa11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kxd1Q80XH1 177 aa11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cct8l1Q80YT3 562 aa11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pank4Q80YV4 820 aa11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cstf2Q8BIQ5 580 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 EmsyQ8BMB0 1264 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.4 ms