RNA–Protein interactions for RNA: YML043C

RRN11, Transcript of Component of the core factor (CF) rDNA transcription factor complex, yeastyeast

Gene RRN11, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11YML043C YOR338WQ99326 363 aa3.61□□□□□ -1.83
RRN11YML043C ENV10Q99382 181 aa3.61□□□□□ -1.83
RRN11YML043C FIG2P25653 1609 aa3.61□□□□□ -1.83
RRN11YML043C MSB2P32334 1306 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C RPA12P32529 125 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C SWD2P36104 329 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C VID24P38263 362 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C INM1P38710 295 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C YIL169CP40442 995 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C YIR016WP40572 265 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C YPL039WQ03080 316 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C NAT3Q06504 195 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C SYM1Q06563 197 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C SME1Q12330 94 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C YLR412C-AQ3E742 68 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C BOL1Q3E793 110 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C FMP49A0A023PZB3 126 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C COX9P07255 59 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C RFA2P26754 273 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C AUR1P36107 401 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C FMP46P36141 133 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C PHO88P38264 188 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C ARC40P38328 384 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C MMS2P53152 137 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C CAX4P53223 239 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C YGR219WP53307 113 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C BUD25P85052 153 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C SDC1Q03323 175 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C YMR103CQ04436 120 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C YFH1Q07540 174 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C FCY1Q12178 158 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN11YML043C CYR1P08678 2026 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RRN11YML043C YLL053CP0CD98 152 aa3.59□□□□□ -1.84
RRN11YML043C MRS4P23500 304 aa3.59□□□□□ -1.84
RRN11YML043C NHP2P32495 156 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
RRN11YML043C PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data3.59□□□□□ -1.84not detected
RRN11YML043C MRP21P38175 177 aa3.59□□□□□ -1.84
RRN11YML043C LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data3.59□□□□□ -1.84not detected
RRN11YML043C CTK2P46962 323 aa3.59□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YLR152CP54072 576 aa3.59□□□□□ -1.84
RRN11YML043C SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YKL023C-AQ2V2P3 75 aa3.59□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YAL063C-AQ3E791 96 aa3.59□□□□□ -1.84
RRN11YML043C SNF11P38956 169 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YAR068WP39564 161 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YEL028WP39989 153 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN11YML043C SFT1P43682 97 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN11YML043C BAT2P47176 376 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RRN11YML043C KNH1P50112 268 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN11YML043C VPS71Q03433 280 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN11YML043C TRS23Q03784 219 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YDL242WQ07746 117 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN11YML043C NDD1Q08887 554 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RRN11YML043C DFM1Q12743 341 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RRN11YML043C RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YFL041W-AQ3E817 63 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN11YML043C MDM10P18409 493 aa3.57□□□□□ -1.84
RRN11YML043C TOM40P23644 387 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RRN11YML043C AGA2P32781 87 aa3.57□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YPT10P38146 199 aa3.57□□□□□ -1.84
RRN11YML043C SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data3.57□□□□□ -1.84 RIP-Chip
RRN11YML043C BRR6P53062 197 aa3.57□□□□□ -1.84
RRN11YML043C HSK3P69852 69 aa3.57□□□□□ -1.84
RRN11YML043C MRX11Q03079 207 aa3.57□□□□□ -1.84
RRN11YML043C SLM3Q12093 417 aa3.57□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YNL277W-AQ3E7Z0 62 aa3.57□□□□□ -1.84
RRN11YML043C ODC2Q99297 307 aa3.57□□□□□ -1.84
RRN11YML043C PBI2P0CT04 75 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YCR050CP25630 102 aa3.56□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YPS1P32329 569 aa3.56□□□□□ -1.84
RRN11YML043C PAM17P36147 197 aa3.56□□□□□ -1.84
RRN11YML043C ANS1P38832 159 aa3.56□□□□□ -1.84
RRN11YML043C ELO1P39540 310 aa3.56□□□□□ -1.84
RRN11YML043C MST28P39552 234 aa3.56□□□□□ -1.84
RRN11YML043C VPS25P47142 202 aa3.56□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YGR164WP53291 111 aa3.56□□□□□ -1.84
RRN11YML043C SWT21P53873 357 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RRN11YML043C MET31Q03081 177 aa3.56□□□□□ -1.84
RRN11YML043C HPA2Q06592 156 aa3.56□□□□□ -1.84
RRN11YML043C RAF1Q06891 181 aa3.56□□□□□ -1.84
RRN11YML043C GEP3Q08622 556 aa3.56□□□□□ -1.84
RRN11YML043C COX5AP00424 153 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN11YML043C RPL28P02406 149 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RRN11YML043C MDH2P22133 377 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YCR025CP25352 136 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN11YML043C AHT1P29589 182 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN11YML043C IES6P32617 166 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN11YML043C SVP26P38869 228 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN11YML043C SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data3.55□□□□□ -1.84not detected
RRN11YML043C TIS11P47977 285 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YML122CQ03207 126 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN11YML043C LPP1Q04396 274 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YOR105WQ08504 108 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN11YML043C KSH1Q8TGJ3 72 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN11YML043C YCL021W-AQ96VH3 125 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN11YML043C CDC39P25655 2108 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RRN11YML043C RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.9 ms