RNA–Protein interactions for RNA: YLR141W

RRN5, Transcript of Protein involved in transcription of rDNA by RNA polymerase I, yeast

Gene RRN5, Length 1,092 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN5	YLR141W	MLF3	P32047	452 aa		10.87	□□□□□ -0.67
RRN5	YLR141W	MSK1	P32048	576 aa		10.87	□□□□□ -0.67
RRN5	YLR141W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
RRN5	YLR141W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
RRN5	YLR141W	COX12	Q01519	83 aa		10.87	□□□□□ -0.67
RRN5	YLR141W	MRS1	P07266	363 aa		10.86	□□□□□ -0.67
RRN5	YLR141W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
RRN5	YLR141W	UBC12	P52491	188 aa		10.86	□□□□□ -0.67
RRN5	YLR141W	LOA1	Q06508	300 aa		10.86	□□□□□ -0.67
RRN5	YLR141W	NNK1	P36003	928 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RRN5	YLR141W	MIG3	P39943	394 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RRN5	YLR141W	HUA1	P40325	198 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RRN5	YLR141W	MRPS8	Q03799	155 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RRN5	YLR141W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
RRN5	YLR141W	YHR173C	P38864	112 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RRN5	YLR141W	VMA7	P39111	118 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RRN5	YLR141W	SNN1	P48232	102 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RRN5	YLR141W	TOM7	P53507	60 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RRN5	YLR141W	YPR063C	Q12160	140 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RRN5	YLR141W	ERV2	Q12284	196 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RRN5	YLR141W	PAU1	P0CE88	120 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RRN5	YLR141W	PAU14	P0CE89	120 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RRN5	YLR141W	PAU6	P0CE90	120 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RRN5	YLR141W	PAU18	P0CE91	120 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RRN5	YLR141W	PAU8	P0CE92	120 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RRN5	YLR141W	PAU11	P0CE93	120 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RRN5	YLR141W	PAU13	P38725	120 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RRN5	YLR141W	PAU10	Q03050	120 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RRN5	YLR141W	PAU20	Q08322	120 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RRN5	YLR141W	PAU9	Q3E770	120 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RRN5	YLR141W	HMX1	P32339	317 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RRN5	YLR141W	RIB5	P38145	238 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RRN5	YLR141W	CCW12	Q12127	133 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RRN5	YLR141W	ATP14	Q12349	124 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RRN5	YLR141W	HTB2	P02294	131 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RRN5	YLR141W	MCM22	P47167	239 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RRN5	YLR141W	RAV2	Q03956	351 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RRN5	YLR141W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RRN5	YLR141W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RRN5	YLR141W	STP4	Q07351	490 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RRN5	YLR141W	YHR022C	P38763	256 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RRN5	YLR141W	YIL163C	P40448	117 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RRN5	YLR141W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
RRN5	YLR141W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
RRN5	YLR141W	SPI1	P40092	148 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RRN5	YLR141W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RRN5	YLR141W	YLR302C	O13544	120 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RRN5	YLR141W	YMR141C	P40211	102 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RRN5	YLR141W	CYB5	P40312	120 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RRN5	YLR141W	YJR096W	P47137	282 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RRN5	YLR141W	CYC7	P00045	113 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RRN5	YLR141W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
RRN5	YLR141W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
RRN5	YLR141W	YFR035C	P43608	114 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RRN5	YLR141W	YOL085C	Q99345	113 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RRN5	YLR141W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	10.72	□□□□□ -0.69
RRN5	YLR141W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	10.72	□□□□□ -0.69
RRN5	YLR141W	AFR1	P33304	620 aa		10.72	□□□□□ -0.69
RRN5	YLR141W	CPT1	P17898	393 aa		10.71	□□□□□ -0.69
RRN5	YLR141W	COQ3	P27680	312 aa		10.71	□□□□□ -0.69
RRN5	YLR141W	YPT10	P38146	199 aa		10.71	□□□□□ -0.69
RRN5	YLR141W	AME1	P38313	324 aa		10.71	□□□□□ -0.69
RRN5	YLR141W	DAD4	P69851	72 aa		10.71	□□□□□ -0.69
RRN5	YLR141W	ECM25	P32525	599 aa		10.7	□□□□□ -0.7
RRN5	YLR141W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		10.7	□□□□□ -0.7
RRN5	YLR141W	LDS1	P31379	325 aa		10.69	□□□□□ -0.7
RRN5	YLR141W	PCC1	Q3E833	88 aa		10.69	□□□□□ -0.7
RRN5	YLR141W	YMR253C	Q04835	414 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RRN5	YLR141W	DAD1	Q12248	94 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RRN5	YLR141W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RRN5	YLR141W	VAR1	P02381	398 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RRN5	YLR141W	SRB6	P32570	121 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RRN5	YLR141W	PHS1	P40857	217 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RRN5	YLR141W	YGL185C	P53100	379 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RRN5	YLR141W	YBR090C	P38253	122 aa		10.66	□□□□□ -0.7
RRN5	YLR141W	YDR215C	Q12240	137 aa		10.66	□□□□□ -0.7
RRN5	YLR141W	TMA17	Q12513	150 aa		10.66	□□□□□ -0.7
RRN5	YLR141W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		10.66	□□□□□ -0.7
RRN5	YLR141W	YCR001W	P25347	104 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RRN5	YLR141W	VAM10	Q08474	114 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RRN5	YLR141W	SEC59	P20048	519 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RRN5	YLR141W	VHS2	P40463	436 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RRN5	YLR141W	HIT1	P46973	164 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RRN5	YLR141W	ATP19	P81451	68 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RRN5	YLR141W	SRP21	P32342	167 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RRN5	YLR141W	FZF1	P32805	299 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RRN5	YLR141W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RRN5	YLR141W	DAD3	P69850	94 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RRN5	YLR141W	HAL1	Q01766	294 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RRN5	YLR141W	SGF11	Q03067	99 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RRN5	YLR141W	POF1	P25576	258 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RRN5	YLR141W	MRPL4	P36517	319 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RRN5	YLR141W	YIL024C	P40543	189 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RRN5	YLR141W	BNS1	P50084	137 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RRN5	YLR141W	YOR105W	Q08504	108 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RRN5	YLR141W	Q0255	P03881	472 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RRN5	YLR141W	NAT3	Q06504	195 aa		10.6	□□□□□ -0.71
RRN5	YLR141W	TIR1	P10863	254 aa		10.59	□□□□□ -0.71
RRN5	YLR141W	POG1	P40473	351 aa		10.59	□□□□□ -0.71
RRN5	YLR141W	YFR045W	P43617	309 aa		10.59	□□□□□ -0.71

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