RNA–Protein interactions for RNA: YLL013C

PUF3, Transcript of Protein of the mitochondrial outer surface, yeast

Gene PUF3, Length 2,640 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUF3	YLL013C	ATX2	Q12067	313 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	CYC7	P00045	113 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	YCR001W	P25347	104 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	YHR022C	P38763	256 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	SNX4	P47057	423 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	SGF11	Q03067	99 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	MRS1	P07266	363 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	CCW12	Q12127	133 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	HTB2	P02294	131 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	PHO23	P50947	330 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	TOM7	P53507	60 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	HMX1	P32339	317 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	NNK1	P36003	928 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	HUA1	P40325	198 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	SHG1	P38337	142 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	YHR173C	P38864	112 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	YJR096W	P47137	282 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	TMA23	Q03525	211 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	RAV2	Q03956	351 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	VAM10	Q08474	114 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	SPC25	P40014	221 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	PAU4	P53427	120 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	TY1A-BR	Q12217	440 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	COX19	Q3E731	98 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	YOL085C	Q99345	113 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PUF3	YLL013C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	CPT1	P17898	393 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	RIB5	P38145	238 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	YLR302C	O13544	120 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	PAU1	P0CE88	120 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	PAU14	P0CE89	120 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	PAU6	P0CE90	120 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	PAU18	P0CE91	120 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	PAU8	P0CE92	120 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	PAU11	P0CE93	120 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	PAU13	P38725	120 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	YMR141C	P40211	102 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	PAU10	Q03050	120 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	PAU20	Q08322	120 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	PAU9	Q3E770	120 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	VMA16	P23968	213 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	DAD4	P69851	72 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	DAD1	Q12248	94 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	YIL163C	P40448	117 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	VHS2	P40463	436 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	KEG1	P43614	200 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	VAR1	P02381	398 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	Q0255	P03881	472 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	MSK1	P32048	576 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	AME1	P38313	324 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	SPI1	P40092	148 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	YPT10	P38146	199 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	RPR2	P40571	144 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	CYB5	P40312	120 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	ECM25	P32525	599 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	SNN1	P48232	102 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	YPS5	P53057	165 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	SNO1	Q03144	224 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	MRPL4	P36517	319 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	COA4	Q05809	96 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	YMR253C	Q04835	414 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	YOR105W	Q08504	108 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	FMP16	Q12497	93 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PUF3	YLL013C	COX16	P47081	118 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	YGL185C	P53100	379 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	YDR366C	P87287	132 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	POG1	P40473	351 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	VMA7	P39111	118 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	RRT13	P40042	185 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	YCH1	P42937	148 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	YFR045W	P43617	309 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	UBC12	P52491	188 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	DIA1	P54005	336 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	ATP19	P81451	68 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	PCC1	Q3E833	88 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	AGA1	P32323	725 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	YBR090C	P38253	122 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	YDL183C	P48569	320 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	UPS3	Q04006	179 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PUF3	YLL013C	TIM22	Q12328	207 aa		4.13	□□□□□ -1.75

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